СОВРЕМЕННЫЕ ТЕНДЕНЦИИ РАЗВИТИЯ УСТОЙЧИВОСТИ БАКТЕРИЙ РОДА SALMONELLA К КЛИНИЧЕСКИ ЗНАЧИМЫМ АНТИБИОТИКАМ (ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)

Аннотация

Бактерии рода Salmonella — одни из ведущих бактериальных возбудителей острых кишечных инфекций, в том числе возникающих в виде групповых заболеваний с пищевым фактором передачи. Сальмонеллёзная инфекция может протекать как гастроэнтерит с развитием осложнений и генерализацией инфекции, нередко регистрируются внекишечные формы, требующие назначения антибактериальной терапии. В настоящее время эффективность многих групп антибиотиков снижена из-за развития резистентности у возбудителя. Национальные системы надзора следят за устойчивостью штаммов Salmonella к антибиотикам «критически важным для медицины» (цефалоспоринам расширенного спектра, фторхинолонам), за множественной устойчивостью. Штаммы Salmonella, устойчивые к хинолонам, отнесены Всемирной Организацией Здравоохранения к группе возбудителей с высоким уровнем приоритетности. В статье охарактеризована текущая ситуация по сальмонеллёзам в мире. Обобщены зарубежные и отечественные данные о ведущих сероварах возбудителя, циркулирующих в последние годы в различных регионах мира, показана частота выявления клинически значимой устойчивости в зависимости от серовара Salmonella в странах, где мониторинг проводится на государственном уровне. Описаны молекулярные механизмы резистентности (хромосомные и плазмидные), выявленные у штаммов Salmonella, показана их распространённость у штаммов различных сероваров. Представлена информация об успешных международных полирезистентных клонах Salmonella, имеющих характерные фенотипы и генотипы резистентности, описаны молекулярные методы изучения механизмов резистентности, показана необходимость и значимость микробиологического мониторинга чувствительности к антибиотикам в эпидемиологическом надзоре за сальмонеллёзами.

Об авторах

Список литературы

European Centre for Disease Prevention and Control. Salmonellosis. In: ECDC. Annual epidemiological report for 2016. Stockholm: ECDC; 2019. Available at: https://ecdc.europa.eu/sites/portal/files/documents/AER_for_2016-salmonellosis.pdf

EFSA and ECDC EFSA and ECDC (European Food Safety Authority and European Centre for Disease Prevention and Control), 2019. The European Union One Health 2018 Zoonoses Report. EFSA Journal. 2019; 17(12): 5926, 276 pp.

О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2018 году: Государственный доклад. М.: Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека; 2019. 254 с. Available at: https://rospotrebnadzor.ru/upload/iblock/798/gosudarstvennyy-doklad-o-sostoyanii-sanitarno_epidemiologicheskogo-blagopoluchiya-naseleniya-v-rossiyskoy-federatsii-v-2018-godu.pdf

Отчёт референс-центра по мониторингу возбудителей острых кишечных инфекций (РЦКИ) за 2017 год. Available at: https://www.epid-oki.ru/files/reports/rcki/2017-1.pdf

EFSA and ECDC (European Food Safety Authority and European Centre for Disease Prevention and Control), 2018. The European Union summary report on trends and sources of zoonoses, zoonotic agents and food-borne outbreaks in 2017. EFSA Journal. 2018; 16(12): 5500.

Government of Canada; 2015. Canadian Integrated Program for Antimicrobial Resistance Surveillance (CIPARS) Annual Report 2013. Public Health Agency of Canada, Guelph, Ontario. Available at: https://www.canada.ca/en/public-health/services/surveillance/ canadian-integrated-program-antimicrobial-resistance-surveillance-cipars/cipars-reports.html.

Centers for Disease Control and Prevention (CDC). National Salmonella Surveillance Annual Report, 2016. Atlanta, Georgia: US Department of Health and Human Services, CDC; 2018. Available at: https://www.cdc.gov/nationalsurveillance/pdfs/2016-Salmonella-report-508.pdf.

Jourdan-da Silva N., Fabre L., Robinson E., Fournet N., Nisavanh A., Bruyand M. et al. Ongoing nationwide outbreak of Salmonella Agona associated with internationally distributed infant milk products, France, December 2017. Euro Surveillance. 2018; 23(2): 17-00852.

Рожнова С.Ш., Акулова Н.К., Христюхина О.А. Перспективы организации расширенной системы надзора за сальмонеллезами в России. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2015; 6(85): 28-34.

Crump J.A., Sjölund-Karlsson M., Gordon M.A., Parry C.M. Epidemiology, clinical presentation, laboratory diagnosis, antimicrobial resistance, and antimicrobial management of invasive Salmonella infections. Clinical Microbiology Reviews. 2015; 28(4): 901-37.

EFSA (European Food Safety Authority) and ECDC (European Centre for Disease Prevention and Control), 2019. The European Union summary report on antimicrobial resistance in zoonotic and indicator bacteria from humans, animals and food in 2018. EFSA Journal. 2019; 17(2): 5598.

CDC. National Antimicrobial Resistance Monitoring System (NARMS) Now: Human Data. Atlanta, Georgia: U.S. Department of Health and Human Services, CDC. Available at: https://www.cdc.gov/narmsnow.

CDC. National Antimicrobial Resistance Monitoring System for Enteric Bacteria (NARMS): Human Isolates Surveillance Report for 2015 (Final Report). Atlanta, Georgia: U.S. Department of Health and Human Services, CDC, 2018. Available at: https://www.cdc.gov/narms/pdf/2015-NARMS-Annual-Report-cleared_508.pdf.

Jeon H.Y., Kim Y.B., Lim S.K., Lee Y.J., Seo K.W. Characteristics of cephalosporin-resistant Salmonella isolates from poultry in Korea, 2010-2017. Poultry Science. 2019; 98(2): 957-65.

Kuang D., Zhang J., Xu X., Shi W., Yang X., Su X. et al. Increase in ceftriaxone resistance and widespread extended-spectrum β-Lactamases Genes Among Salmonella enterica from Human and Nonhuman Sources. Foodborne Pathogen Diseases. 2018; 15(12): 770-5.

Ranjbar R., Ardashiri M., Samadi S., Afshar D. Distribution of extended-spectrum β-lactamases (ESBLs) among Salmonella serogroups isolated from pediatric patients. Iranian Journal of Microbiology. 2018; 10(5): 294-9.

Hindermann D., Gopinath G., Chase H., Negrete F., Althaus D., Zurfluh K. et al. Salmonella enterica serovar Infantis from Food and Human Infections, Switzerland, 2010-2015: Poultry-Related Multidrug Resistant Clones and an Emerging ESBL Producing Clonal Lineage. Frontiers in Microbiology. 2017; 8: 1322.

Chen C.Y., Hsieh P.H., Chang C.Y., Yang S.T., Chen Y.H., Chang K. et al. Molecular epidemiology of the emerging ceftriaxone resistant non-typhoidal Salmonella in southern Taiwan. Journal of Microbiology, Immunology and Infection. 2019; 52(2): 289-96.

Castellanos L.R., van der Graaf-van Bloois L., Donado-Godoy P., Donado-Godoy P., Leon M., Clavijo V. et al. Genomic Characterization of Extended-Spectrum Cephalosporin-Resistant Salmonella enterica in the Colombian Poultry Chain. Frontiers in Microbiology. 2018; 9: 2431.

Fernández J., Guerra B., Rodicio M.R. Resistance to Carbapenems in Non-Typhoidal Salmonella enterica Serovars from Humans, Animals and Food. Veterinary sciences. 2018; 5(2): 40.

Ахметова Л.И., Розанова С.М. Чувствительность к антимикробным препаратам штаммов шигелл и сальмонелл, выделенных в Екатеринбурге. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2000; 2(3): 58-62.

Egorova S., Kaftyreva L., Grimont P.A.D, Weill F-X. Prevalence and characterization of extended-spectrum cephalosporin resistant non-typhoidal Salmonella isolates in adults in St-Petersburg, Russia (2002-2005). Microbial Drug Resistance. 2007; 13(2): 102-7.

Гончар Н.В., Лазарева И.В., Рычкова С.В., Кветная А.С., Альшаник Л.П., Фомичева Ю.В. и др. Заболеваемость детей сальмонеллезом и уровень резистентности клинических штаммов сальмонелл к антибактериальным препаратам в Санкт-Петербурге. Журнал инфектологии. 2015; 7(1): 80-6.

Милютина Л.Н., Гурьева О.В. Эволюция лекарственной резистентности сальмонелл, выделенных от детей, и ее клиническая значимость. Лаборатория. 2011; 3: 5-7.

Шитова О.И., Казьянин А.В., Захарова Ю.А. Эпидемиологические особенности, биологическая характеристика и чувствительность к антимикробным препаратам сальмонелл, циркулирующих в Пермском крае. Сибирский медицинский журнал. 2011; 26(2): 116-20.

Кузнецова Н.А., Соловьёва А.С., Раков А.В. Чувствительность к антибиотикам у штаммов Salmonella Enteritidis, циркулирующих на территории Сибири и Дальнего Востока, по данным многолетнего мониторинга. Здоровье. Медицинская экология. Наука. 2018; 3: 50-8.

Халиуллина С.В., Анохин В.А., Герасимова Е.С., Леонтьева Н.С., Малышева Л.М., Гутор И.А. Антибиотикорезистентность современных возбудителей внебольничных бактериальных кишечных инфекций у детей. Практическая медицина. 2010;1(40):85-8.

Решетнева И.Т., Перьянова О.В., Дмитриева Г.М., Остапова Т.С. Антибиотикорезистентность сальмонелл, выделенных на территории Красноярского края. Гигиена и санитария. 2015; 94(2): 35-8.

Евмененкова И.Г., Мурач Л.В. Анализ резистентности штаммов Salmonella spp. к антибиотикам в Смоленском регионе за 2012-2017 гг. Смоленский медицинский альманах. 2018; 1: 93-6.

Егорова С.А., Кафтырева Л.А., Сужаева Л.В., Забровская А.В., Войтенкова Е.В., Матвеева З.Н. и др. Устойчивость к антимикробным препаратам и клинически значимые механизмы резистентности штаммов Salmonella, выделенных в 2014-2018 гг. в Санкт-Петербурге, Россия. Клиническая лабораторная диагностика. 2019; 64(10): 620-6.

Kozyreva V.K., Ilina E.N., Malakhova M.V., Carattoli A., Azizov I.S., Tapalski D.V. et al. Long-term dissemination of CTX-M-5-producing hypermutable Salmonella enterica serovar typhimurium sequence type 328 strains in Russia, Belarus, and Kazakhstan. Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 2014; 58(9): 5202-10.

Piddock. Fluoroquinolone resistance in salmonella serovars isolated from humans and food animals. FEMS Microbiology Reviews. 2002; 26: 3-16.

Tadesse G., Tessema T.S., Beyene G., Aseffa A. Molecular epidemiology of fluoroquinolone resistant Salmonella in Africa: A systematic review and meta-analysis. PLoS ONE. 2018; 13(2): e0192575.

McDermott P.F., Tyson G.H., Kabera C., Chen Y., Li C., Folster J.P. et al. Whole-genome sequencing for detecting antimicrobial resistance in nontyphoidal Salmonella. Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 2016; 60: 5515-20.

Wong M.H., Chan E.W., Liu L.Z., Chen S. PMQR genes oqxAB and aac(6 )Ib-cr accelerate the development of fluoroquinolone resistance in Salmonella typhimurium. Frontiers in Microbiology. 2014; 5: 521.

Елиусизова А.Б., Шубин Ф.Н., Кузнецова Н.А., Бахолдина С.И. Чувствительность к фторхинолонам сальмонелл в Сибири и на Дальнем Востоке. Тихоокеанский медицинский журнал. 2010; 4: 51-4.

Harvey R.R., Friedman C.R., Crim S.M., Judd M., Barrett K.A., Tolar B. et al. Epidemiology of Salmonella enterica Serotype Dublin Infections among Humans, United States, 1968-2013. Emerging Infectious Diseases. 2017; 23(9): 1493-1501.

Petrovska L., Mather A.E., AbuOun M., Branchu P., Harris S.R., Connor T. et al. Microevolution of Monophasic Salmonella Typhimurium during Epidemic, United Kingdom, 2005-2010.Emerging Infectious Diseases. 2016; 22(4): 617-24.

Gymoese P., Sørensen G., Litrup E., Olsen J.E., Nielsen E.M., Torpdahl M. Investigation of Outbreaks of Salmonella enterica Serovar Typhimurium and Its Monophasic Variants Using Whole-Genome Sequencing, Denmark. Emerging Infectious Diseases. 2017; 23(10): 1631-9.

Hawkey J., Le Hello S., Doublet B., Granier S.A., Hendriksen R.S., Fricke W.F. et al. Global phylogenomics of multidrug-resistant Salmonella enterica serotype Kentucky ST198. Microbial Genomics. 2019; 5(7): e000269.

Crim S., Chai S., Reynolds J., Swanson K., Nisler A., Gould H. et al. Salmonella enterica serotype Newport infections in the US, 2004-2013: increased incidence investigated through four surveillance systems. Foodborne Pathogens and Disease. 2018; 15(10): 612-20.

Ranjbar R., Rahmati H., Shokoohizadeh L. Detection of common clones of Salmonella enterica serotype Infantis from human sources in Tehran hospitals. Gastroenterology and Hepatology From Bed to Bench. 2018; 11(1): 54-9.

Hoszowski A., Zając M., Lalak A., Przemyk P., Wasyl D. Fifteen years of successful spread of Salmonella enterica serovar Mbandaka clone ST413 in Poland and its public health consequences. Annals of Agricultural and Environmental Medicine. 2016; 23(2): 237-41.

WHO publishes list of bacteria for which new antibiotics are urgently needed. News Release 27.02.2017. Available at https://www.who.int/ru/news-room/detail/27-02-2017-who-publishes-list-of-bacteria-for-which-new-antibiotics-are-urgently-needed.

Ключевые слова