Аннотация
Представлены данные комплексного сравнительного исследования таксономического состава резидентного микробиома опухолей 26 больных немелкоклеточным раком легкого. Анализ таксономического разнообразия выявил 10 типов, 280 родов и 788 видов микроорганизмов. Анализ относительного содержания и прогностической значимости проведен для 62 доминирующих родов. Обнаружены отличия относительного содержания бактерий родов Acinetobacter, Halomonas и Chryseobacterium между опухолевой и условно нормальной тканью легкого, однако их диагностический потенциал не подтвержден. Проведенный корреляционный анализ не выявил взаимосвязи содержания различных родов бактерий с гистологическим типом опухоли, ее локализацией и возрастом пациентов. Обнаружены различия в содержании исследованных бактерий в зависимости от стадии заболевания, наличия регионарных метастазов и дифференцировки опухоли. Показана прогностическая значимость бактерий родов Variovorax и Pseudoclavibacter при немелкоклеточном раке легкого. Полученные результаты могут быть использованы при разработке новых эффективных методов диагностики и прогноза немелкоклеточного рака легкого.
Список литературы
Lee S.H., Sung J.Y., Yong D., Chun J., Kim S.Y., Song J.H. et al. Characterization of microbiome in bronchoalveolar lavage fluid of patients with lung cancer comparing with benign mass like lesions. Lung Cancer. 2016; 102: 89-95. https://doi.org/10.1016/j.lungcan.2016.10.016
Bourigault M.L., Vacher R., Rose S., Olleros M.L., Janssens J.P., Quesniaux V.F. et al. Tumor necrosis factor neutralization combined with chemotherapy enhances Mycobacterium tuberculosis clearance and reduces lung pathology. Am. J. Clin. Exp. Immunol. 2013; 2(1): 124-34.
Laroumagne S., Salinas-Pineda A., Hermant C., Murris M., Gourraud P.A., Do C. et al. Incidence and characteristics of bronchial colonisation in patient with lung cancer: a retrospective study of 388 cases. Rev. Mal. Respir. 2011; 28(3): 328-35. https://doi.org/10.1016/j.rmr.2010.05.020
Hosgood H.D., Sapkota A.R., Rothman N., Rohan T., Hu W., Xu J. et al. The potential role of lung microbiota in lung cancer attributed to household coal burning exposures. Environ Mol. Mutagen. 2014; 55(8): 643-51. https://doi.org/10.1002/em.21878
Chang S.H., Mirabolfathinejad S.G., Katta H., Cumpian A.M., Gong L., Caetano M.S. et al. T- helper 17 cells play a critical pathogenic role in lung cancer. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2014; 111(15): 5664-9. https://doi.org/10.1073/pnas.1319051111
Mao Q., Jiang F., Yin R., Wang J., Xia W., Dong G. et al. Interplay between the lung microbiome and lung cancer. Cancer Letters. 2018; 415: 40-8. https://doi.org/10.1016/j.canlet.2017.11.036
Klindworth A., Pruesse E., Schweer T., Peplies J., Quast C., Horn M. et al. Evaluation of general 16S ribosomal RNA gene PCR primers for classical and next-generation sequencing-based diversity studies. Nucleic Acids Res. 2013; 41(1): e1. https://doi.org/10.1093/nar/gks808
Yang J., Mu X., Wang Y., Zhu D., Zhang J., Liang C. et al. Dysbiosis of the Salivary Microbiome Is Associated With Non-smoking Female Lung Cancer and Correlated With Immunocytochemistry Markers. Frontiers in oncology. 2018; 8: 520. https://doi.org/10.3389/fonc.2018.00520
Herbst R.S., Heymach J.V., Lippman S.M. Lung cancer. New Engl. J. Med. 2008; 359(13): 1367-80. https://doi.org/10.1056/NEJMra0802714
Pauly J.L., Paszkiewicz G. Cigarette smoke, bacteria, mold, microbial toxins, and chronic lung inflammation. J. Oncol. 2011; 2011: 819129. https://doi.org/10.1155/2011/819129
Gomes S., Cavadas B., Ferreira J.C., Marques P.I., Monteiro C., Sucena M. et al. Profiling of lung microbiota discloses differences in adenocarcinoma and squamous cell carcinoma. Scientific reports. 2019; 9(1): 12838. https://doi.org/10.1038/s41598-019-49195-w
Huang D., Su X., Yuan M., Zhang S., He J., Deng Q. et al. The characterization of lung microbiome in lung cancer patients with different clinicopathology. Am. J. Cancer Res. 2019; 9(9): 2047-63.
Peters B.A., Hayes R.B., Goparaju C., Reid C., Pass H.I., Ahn J. The Microbiome in Lung Cancer Tissue and Recurrence-Free Survival. Cancer epidemiology, biomarkers & prevention : a publication of the American Association for Cancer Research, cosponsored by the American Society of Preventive Oncology. 2019; 28(4): 731-40. https://doi.org/10.1158/1055-9965.EPI-18-0966