ВЫЯВЛЕНИЕ ГЕНА БЕЛКА-АДГЕЗИНА BABA2 У КЛИНИЧЕСКИХ ИЗОЛЯТОВ HELICOBACTER PYLORI

Аннотация

Приведены результаты сравнительного анализа эффективности двух наборов праймеров для детекции и оценки распространённости гена babA2 (контролирует синтез фактора вирулентности функционально-активного белка-адгезина BabА) у 52 клинических изолятов H. pylori, выделенных от пациентов с хроническим гастритом (ХГ, n=32), язвенным поражением двенадцатиперстной кишки (ЯДК, n=16) и раком желудка (РЖ, n=4) в Санкт-Петербурге. Детекция гена babA2 проводилась методом ПЦР с использованием 271 п.н.- и 832 п.н.- наборов праймеров с последующим секвенированием продуктов амплификации. Наибольшая доля babA2-позитивных штаммов — 90,4% (47/52) выявлена с использованием праймеров для детекции продукта амплификации 271 п.н.; детекция ПЦР-продукта 832 п.н. наблюдалась лишь в 51,9% случаев (27/52), статистически значимые различия не установлены (р>0,05). Биоинформационный анализ выявил гомологию секвенированных по Сэнгеру ПЦР-продуктов 271 п.н. и 832 п.н. гена babA2 с участками генов babA2, babA1 и химерного генома (babB/babA1) штаммов H. pylori, аннотированных в базе данных NCBI. Вне зависимости от использованного набора праймеров, связь между выявлением гена babA2 у штаммов H. pylori с принадлежностью пациентов к группам с различными формами заболевания (ХГ, ЯДК, РЖ) статистически не значима (р>0,05). Анализ сочетания трёх генов вирулентности babA2, cagA, vacAs1 не выявил связи babA2+/cagA+/vacAs1+ генотипа штаммов H. pylori с различными клиническими проявлениями H. pylori-инфекции (р>0,05). Ни один из двух наборов праймеров (271 п.н., 832 п.н.) не является достаточно надёжным для детекции гена babA2 с целью оценки вирулентности российских штаммов H. pylori.

Об авторах

Список литературы

de Brito B.B., da Silva F.A.F., Soares A.S., Pereira V.A., Santos M.L.C., Sampaio M.M., et al. Pathogenesis and clinical management of Helicobacter pylori gastric infection. World J. Gastroenterol. 2019; 25(37): 5578-89. https://doi.org/10.3748/wjg.v25.i37.5578

Xu C., Soyfoo D.M., Wu Y., Xu S. Virulence of Helicobacter pylori outer membrane proteins: an updated review. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2020; 39:1821-30. https://doi.org/10.1007/s10096-020-03948-y

Ilver D., Arnqvis A., Ogren J., Frick I.M., Kersulyte D., Incecik E.T., Berg D.E., Covacci A., Engstrand L. Helicobacter pylori adhesin binding fucosylated histo-blood group antigens revealed by retagging. Science. 1998; 279(5349): 373-7. https://doi.org/10.1126/science.279.5349.373

Šterbenc A., Lunar M.M., Homan M., Luzar B., Zidar N., Poljak M. Prevalence of the Helicobacter pylori babA2 gene in children mainly depends on the PCR primer set used. Can. J. Infect. Dis. Med. Microbiol. 2020; 4080248. https://doi.org/10.1155/2020/4080248

Yamaoka Y. Roles of Helicobacter pylori BabA in gastroduodenal pathogenesis. World J. Gastroenterol. 2008; 14(27): 4265-72. https://doi.org/10.3748/wjg.14.4265

Pride D.T., Blaser M.J. Concerted evolution between duplicated genetic elements in Helicobacter pylori. Mol. Biol. 2002; 316: 629-42. https://doi.org/10.1006/jmbi.2001.5311

Gerhard M., Lehn N., Neumayer N., Borén T., Rad R., Schepp W. et al. Clinical relevance of the Helicobacter pylori gene for blood-group antigenbinding adhesion. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1999; 96(22): 12778-83. https://doi.org/10.1073/pnas.96.22.12778

Lee D.-H., Ha J.-H., Shin J.-I., Kim K.-M., Choi J.-G., Park S. et al. Increased risk of severe gastric symptoms by virulence factors vacAs1c, alpA, babA2, and hopZ in Helicobacter pylori infection. J. Microbiol. Biotechnol. 2021; 31(3): 368-79. https://doi.org/10.4014/jmb.2101.01023

Torres L.E., Melián K., Moreno A., Alonso J., Sabatier C.A., Hernández M. et al. Prevalence of vacA, cagA and babA2 genes in Cuban Helicobacter pylori isolates. World J. Gastroenterol. 2009; 15(2): 204-10. https://doi.org/10.3748/wjg.15.204

Olfat F.O., Zheng Q., Oleastro M., Voland P., Borén T., Karttunen R. et al. Correlation of the Helicobacter pylori adherence factor BabA with duodenal ulcer disease in four European countries. FEMS Immunol. Med. Microbiol. 2005; 44(2): 151-6. https://doi.org/10.1016/j.femsim.2004.10.010

Sheu B.S., Sheu S.M., Yang H.B., Huang A.H., Wu J.J. Host gastric Lewis expression determines the bacterial density of Helicobacter pylori in babA2 genopositive infection. Gut. 2003; 52(7): 927-32. https://doi.org/10.1136/gut.52.7.927

Fujimoto S., Olaniyi Ojo O., Arnqvist A., Wu J.Y., Odenbreit S., Haas R. et al. Helicobacter pylori BabA expression, gastric mucosal injury, and clinical outcome. Clin. Gastroenterol. Hepatol. 2007; 5(1): 49-58. https://doi.org/10.1016/j.cgh.2006.09.015

Almeida N., Donato M.M., Romãozinho J.M., Luxo C., Cardoso O., Cipriano M.A. et al. Correlation of Helicobacter pylori genotypes with gastric histopathology in the central region of a South-European Country. Dig. Dis. Sci. 2015; 60: 74-85. https://doi.org/10.1007/s10620-014-3319-8

Podzorski R.P., Podzorski D.S., Wuerth A., Tolia V. Analysis of the vacA, cagA, cagE, iceA, and babA2 genes in Helicobacter pylori from sixty-one pediatric patients from the Midwestern United States. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2003; 46(2): 83-8. https://doi.org/10.1016/S0732-8893(03)00034-8

Lehours P., Menard A., Dupouy S., Bergey B., Richy F., Zerbib F. et al. Evaluation of the association of nine Helicobacter pylori virulence factors with strains involved in low-grade gastric mucosa-associated lymphoid tissue lymphoma. Infect. Immun. 2004; 72: 880-8. https://doi.org/10.1128/IAI.72.2.880-888.2004

Zambon C.F., Navaglia F., Basso D., Rugge M., Plebani M. Helicobacter pylori babA2, cagA, and s1 vacA genes work synergistically in causing intestinal metaplasia. J. Clin. Pathol. 2003; 56(4): 287-91. https://doi.org/10.1136/jcp.56.4.287

Boyanova L., Yordanov D., Gergova G., Markovska R., Mitov I. Association of iceA and babA genotypes in Helicobacter pylori strains with patient and strain characteristics. Antonie van Leeuwenhoek. 2010; 98: 343-50. https://doi.org/10.1007/s10482-010-9448-y

González-Vázquez R., Córdova-Espinoza M.G., Escamilla-Gutiérrez A., Morales-Méndez I., Ochoa-Pérez S.A., Armendáriz-Toledano F., et al. Frequency of virulence genes in mixed infections with Helicobacter pylori strains from a Mexican population. Rev.Gastroenterol.Mex. 2016; 81(1): 11-20. https://doi.org/10.1016/j.rgmx.2015.10.001

Chomvarin C., Namwat W., Chaicumpar K., Mairiang P., Sangchan A., Sripa B. et al. Prevalence of Helicobacter pylori vacA, cagA, cagE, iceA and babA2 genotypes in Thai dyspeptic patients.Int. J. Infect. Dis. 2008; 12(1): 30-6. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2007.03.012

Elhashima T., Mahmuda M.I.M., Amjadb N., Harunc N., Alania I.M. Clinical and histopathological relevance of Helicobacter pylori babA2 genotype. 2016; 15(2): 43-9. https://doi.org/10.31436/imjm.v15i2.388

Ghosh P., Sarkar A., Ganguly M., Raghwan, Alam J., De R. et al. Helicobacter pylori strains harboring babA2 from Indian subpopulation are associated with increased virulence in ex vivo study. Gut Pathog. 2016; 8(1). https://doi.org/10.1186/s13099-015-0083-z

Lai C.H., Kuo C.H., Chen Y.C., Chao F.Y., Poon S.K., Chang C.S., et al. High prevalence of cagA- and babA2-positive Helicobacter pylori clinical isolates in Taiwan. J. Clin. Microbiol. 2020; 40(10): 3860-2. https://doi.org/10.1128/JCM.40.10.3860-3862.2002

Chiurillo M.A., Moran Y., Cañas M., Valderrama E., Granda N., Sayegh M. et al. Genotyping of Helicobacter pylori virulence-associated genes shows high diversity of strains infecting patients in western Venezuela.Int. J. of Inf. Dis. 2013; 17(9): 750-6. https://doi.org/10.1016/j.ijid.2013.03.004

Momynaliev K., Smirnova O., Kudryavtseva L., Govorun V. Helicobacter pylori Genotypes in Russia. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2003; 22: 573-4. https://doi.org/10.1007/s10096-003-0987-2

Березняк Е.А., Сорокин В.М., Карпова И.О., Ступина Н.А., Терентьев А.Н. Особенности генотипов штаммов Helicobacter pylori, циркулирующих в Ростовской области. Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2013; 4(71): 30-3.

Говорун В.М., Момыналиев К.Т., Смирнова О.В., Челышева В.В., Кудрявцева Л.В., Сергиенко В.И. и др. Современные подходы к молекулярной диагностике и типированию клинических изолятов Helicobacter pylori в России. Российский журнал гастроэнтерологии, гепатологии, колопроктологии. 2002; 12(3): 57-65.

Ахтереева А.Р., Давидюк Ю.Н., Файзуллина Р.А., Ивановская К.А., Сафин А.Г., Сафина Д.Д. и др. Распространённость генотипов Helicobacter pylori у пациентов с гастродуоденальной патологией в Казани. Казанский медицинский журнал. 2017; 98(5): 723-8. https://doi.org/10.17750/KMJ2017-723

Макаренко Е.В., Воропаева А.В. Гены vacA, cagA и babA Helicobacter pylori у больных дуоденальной язвой и хроническим гастритом. Вестник Витебского государственного медицинского университета. 2004; 3(1): 74-7.

Ключевые слова