Аннотация
Коронавирусная инфекция продолжает распространяться по всему миру. В связи с этим цель данной работы — разработать набор реагентов для качественного выявления РНК вируса SARS-CoV-2. Набор разработан в ЗАО «ЭКОлаб». Для разработки набора были использованы 20 положительных образцов. Метод исследования состоял из нескольких этапов: выделение РНК SARS-CoV-2, реакции обратной транскрипции РНК и ПЦР-амплификации кДНК с одновременной детекцией результата в режиме «реального времени». Основные характеристики набора: аналитическая чувствительность — 100%, специфичность — 100%, точность — 100%. Таким образом, разработанная нами методика диагностики новой коронавирусной инфекции на основе ОТ-ПЦР в режиме реального времени позволяет качественно и быстро выявлять РНК бетакоронавируса в клиническом материале больных и здоровых лиц с подозрением на коронавирусную инфекцию и другими симптомами ОРВИ.
Список литературы
Chen Y., Liu Q., Guo D. Emerging coronaviruses: Genome structure, replication, and pathogenesis. J. Med. Virol. 2020; 92: 418-23. https://doi.org/10.1002/jmv.25681
Лахтин В.М., Лахтин М.В., Комбарова С.Ю., Давыдкин В.Ю., Мелихова А.В., Давыдкин И.Ю., Миронов А.Ю., Алешкин В.А. Ковид как мультицелевая инфекция: превентивные стратегии управления. Эпидемиологический надзор за актуальными инфекциями: новые угрозы и вызовы: Сборник научных трудов Всероссийской научно-практической конференции с международным участием, посвященной 100-летию академика И.Н. Блохиной, Нижний Новгород, 26-27 апреля 2021 г. Зайцева Н.Н., ред. Нижний Новгород: Медиаль; 2021; 1: 55-7
Lau S.K., Poon R.W., Wong B.H., Wang M., Huang Y., Xu H. et al. Coexistence of different genotypes in the same bat and serological characterization of Rousettus bat coronavirus HKU9 belonging to a novel Betacoronavirus subgroup. J. Virol. 2010 Nov; 84(21): 11385-94.
Menachery V.D., Yount B.L. Jr., Debbink K., Agnihothram S., Gralinski L.E., Plante J.A. et al. A SARS-like cluster of circulating bat coronaviruses shows potential for human emergence. Nat. Med. 2015 Dec; 21(12): 1508-13.
Woo P.C., Huang Y., Lau S.K., Yuen K.Y. Coronavirus genomics and bioinformatics analysis. Viruses. 2010; 2: 1804-1820. https://doi.org/10.3390/v2081803
Romano M., Ruggiero A., Squeglia F., Maga G., Berisio R. A Structural View of SARS-CoV-2 RNA Replication Machinery: RNA Synthesis, Proofreading and Final Capping. Cells. 2020; 9: 1267.
Lu H., Stratton C.W., Tang Y.W. Outbreak of pneumonia of unknown etiology in Wuhan, China: The mystery and the miracle. J. Med. Virol. 2020; 92: 401-2. https://doi.org/10.1002/jmv.25678
https://covid19.who.int/
https://www.rospotrebnadzor.ru/
Xu X.W., Wu X.X., Jiang X.G., Xu K.J., Ying L.J., Ma C.L. et al. Clinical findings in a group of patients infected with the 2019 novel coronavirus (SARS-Cov-2) outside of Wuhan, China: retrospective case series. BMJ. 2020; 368: m606. https://doi.org/10.1136/bmj.m606
He F., Deng Y., Li W. Coronavirus disease 2019: What we know? J. Med. Virol. 2020; 92: 719-25. https://doi.org/10.1002/jmv.25766
Wu Z., McGoogan J.M. Characteristics of and Important Lessons from the Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Outbreak in China: Summary of a Report of 72,314 Cases from the Chinese Center for Disease Control and Prevention. JAMA. 2020; 323: 1239-42. https://doi.org/10.1001/jama.2020.2648
Fozouni P., Son S., Díaz de León Derby M., Knott G.J., Gray C.N., D’Ambrosio M.V. et al. Amplification-free detection of SARS-CoV-2 with CRISPR-Cas13a and mobile phone microscopy. Cell. 2021 Jan 21; 184(2): 323-39. https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.12.001
Tevfik Dorak М., ed. Real-time PCR School of Clinical Medical Sciences (Child Health). Newcastle University, Newcastle-upon-Tyne (UK); by Taylor & Francis; 2006.
Хавкина Д.А., Руженцова Т.А., Чухляев П.В., Гарбузов А.А., Шушакова Е.К. и др. Роль дезинтоксикационной и антиоксидантной терапии в лечении COVID-19: теория и практика. Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2020; 10 (2): 62-9.
Руженцова Т.А., Чухляев П.В., Хавкина Д.А., Гарбузов А.А., Плоскирева А.А., Осешнюк Р.А., Солуянова Т.Н., Шестакова И.В. и др. Возможности этиотропной терапии коронавирусной инфекции, вызванной SARS-CoV-2, у амбулаторных пациентов. Медицинский оппонент. 2020; 1(9): 48-58.
Руженцова Т.А., Чухляев П.В., Хавкина Д.А., Гарбузов А.А., Плоскирева А.А., Осешнюк Р.А. и др. Эффективность и безопасность применения фавипиравира в комплексной терапии COVID-19 легкого и среднетяжелого течения. Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2020; 4(35): 26-38.