Аннотация
Раннее выявление изолятов микобактерий туберкулеза (МБТ), устойчивый: к противотуберкулезным препаратам (ПТП), крайне необходимо для оптимизации схемы лечения и предотвращения распространения устойчивых штаммов. В обзоре литературы рассматриваются данные о новом, быстром и недорогом методе детекции мутаций в генах МБТ, отвечающих за множественную лекарственную устойчивость (МЛУ). Молекулярно-генетический метод HRM (high resolution melting curve analysis) основан на проведении амплификации фрагментов ДНК с последующим анализом их кривых плавления с высоким разрешением. Метод показал высокую чувствительность и специфичность. В отличие от других молекулярно-генетических методов определения резистентности МБТ HRM-анализ позволяет выявлять все мутации в интересующих фрагментах генов, различать ДНК мутантного и дикого типов в их смеси, не имеет контаминационной опасности. HRM-анализ может стать основой для создания диагностических наборов с целью выявления туберкулеза с МЛУ (МЛУ-ТБ).
Об авторах
Лаврова Ольга ИгоревнаФБУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора 111123, Москва, ул. Новогиреевская, 3а отдел молекулярной диагностики и эпидемиологии, канд. биол. наук, науч. сотр. ilinir@mail.ru
Список литературы
Pai M., Kalantri S., Pascopella L., Riley L., Reingold A.; Bacteriophage-based assays for the rapid detection of rifampicin resistance in Mycobacterium tuberculosis: A meta-analysis. J. Infect. 2005; 51: 175-87.
Li W., Matsuoka M., Kai M., Thapa P., Khadge S., Hagge D. et al.; Real-time PCR and high-resolution melt analysis for rapid detection of Mycobacterium leprae drug resistance mutations and strain types. J. Clin. Microbiol. 2012; 50(3): 742-53.
Van Deun A., Martin A., Palomino, J. Diagnosis of drugresistant tuberculosis: reliability and rapidity of detection. Int. J. Tuberc. Lung Dis. 2010; 14: 131-40.
Lee A., Ong D., Wong J., Siu G., Yam W. High-resolution melting analysis for the rapid detection of fluoroquinolone and streptomycin resistance in Mycobacterium tuberculosis. PLoS One. 2012; 7(2): 1-8.
Choi G. E., Lee S. M., Yi J., Hwang S., Kim H., Lee Y. et al.; High-resolution melting curve analysis for rapid detection of rifampin and isoniazid resistance in Mycobacterium tuberculosis clinical isolates. J. Clin. Microbiol. 2010; 48(11): 3893-8.
Hoek K., Gey van Pittius N., Moolman-Smook H., Carelse-Tofa K., Jordaan A., van der Spuy G. et al. Fluorometric assay for testing rifampin susceptibility of Mycobacterium tuberculosis complex. J. Clin. Microbiol. 2008; 46: 1369-73.
Laurenzo D., Mousa S. Mechanisms of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis and current status of rapid molecular diagnostic testing. Acta Trop. 2011; 119 (1): 5-10.
Ramirez M., Cowart K., Campbell P., Morlock G., Sikes D., Winchell J., Posey J. Rapid detection of multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis by use of real-time PCR and high-resolution melt analysis. J. Clin. Microbiol. 2010; 48(11): 4003-9.
Ririe K., Rasmussen R., Wittwer C. Product differentiation by analysis of DNA melting curves during the polymerase chain reaction. Anal. Biochem. 1997; 245(2): 154-60.
Wittwer C., Reed G., Gundry C., Vandersteen J.G., Pryor R.J. High-resolution genotyping by amplicon melting analysis using LCGreen/ J. Clin. Chem. 2003; 49: 853-60.