ГЕНОТИПИРОВАНИЕ ВИРУСОВ ПАПИЛЛОМЫ ЧЕЛОВЕКА В УРОГЕНИТАЛЬНЫХ МАЗКАХ МЕТОДОМ ПРЯМОЙ ПЦР В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ

Аннотация

Введение. Применение прямой ПЦР, без экстракции нуклеиновых кислот, для выявления инфекционных агентов — хорошая
альтернатива рутинному ПЦР: снижает риск контаминации, вдвое ускоряется время получения результата, снижает се-
бестоимость исследования. Разработана методика прямой ПЦР для генотипирования 18 типов вируса папилломы человека
(ВПЧ) в мультиплексном формате. Первичное и повторное выявление ВПЧ высокого онкогенного риска является фактором
риска развития дисплазий шейки матки.
Материал и методы. Исследовано 60 гинекологических мазков методом прямой ПЦР разработки АО ЭКОлаб и 60 ДНК
из них референсным непрямым набором производства НекстБио (Москва). Все выявленные генотипы ВПЧ подтверждены
секвенированием по Сэнгеру.
Результаты. Данные, полученные с помощью двух наборов и секвенирования по Сэнгеру, совпали. Наибольшая относитель-
ная частота выявлена у ВПЧ 16 и 39 типов (13,3%), частота выявления увеличена для ВПЧ 6, 33, 58 до 11,7%, в случае ВПЧ
56, 59 до 10%. В десяти образцах из 60 (16,7%) выявлена коинфекция ВПЧ, и повышенная частота коинфекции ВПЧ 66.
Обсуждение. Полученные данные генотипирования ВПЧ согласуются с более ранними данными по высокой относительной
частоте выявления генотипов ВПЧ 16 и 31 типов. Отмечена более низкая относительная частота выявления образцов с
коинфекцией ВПЧ высокого риска. В нашей выборке выявлена высокая частота коинфекции ВПЧ 66, как и в данных, полу-
ченных в Китае и Парагвае. Прямая ПЦР и генотипирование ВПЧ, наряду с наборами для самостоятельного забора биома-
териала позволяют сделать скрининг ВПЧ-инфекции более доступным, что важно, как для профилактики ВПЧ-инфекции,
так и скрининга дисплазий и рака шейки матки.
Заключение. Генотипирование ВПЧ успешно проведено при помощи технологии прямой ПЦР

Annotation

Introduction. The use of direct PCR, without nucleic acid extraction, for detection of infectious agents is a good alternative to routine
PCR: it reduces the risk of contamination, doubles the time to obtain a result, and lowers the cost of the study. Direct PCR methodology
for genotyping of 18 HPV types in multiplex format has been developed. Primary and repeated detection of HPV of high oncogenic risk
is a risk factor for the development of cervical dysplasia.
Material and methods. 60 gynecologic smears were examined by direct PCR developed by JSC EKOlab and 60 DNA from them by a
reference non-direct kit produced by NextBio (Moscow). All detected HPV genotypes were confirmed by Sanger sequencing.
Results. The data obtained with the two kits and Sanger sequencing matched. The highest relative frequency was found for HPV16 and
39 types (13.3%), the frequency of detection was increased for HPV6, 33 and 58 to 11.7%, and in the case of HPV56, 59 to 10%. In ten
samples out of 60 (16.7%), HPV coinfection was detected and the frequency of HPV66 coinfection was increased.
Discussion. The HPV genotyping data obtained are consistent with earlier findings of a high relative frequency of detection of HPV16
and 31 type genotypes. A lower relative frequency of detection of samples with high-risk HPV coinfection was noted. Our sample
showed a high frequency of HPV66 coinfection as in the data from China and Paraguay. Direct PCR and HPV genotyping, along
with self-sampling kits, make HPV screening more accessible, which is important for both HPV prevention and screening of cervical
dysplasia and cancer.
Conclusion. HPV genotyping was successfully performed using direct PCR technology.
Key words: direct PCR; HPV genotyping; HPV vaccination; cervical dysplasia; cervical cancer

Об авторах

Список литературы

Ilyin I.I., Beliakov I.S., Mardanly S.G. Genotyping of HPV in urogenital smears by real-time direct PCR.
Klinicheskaya Laboratornaya Diagnostika (Russian Clinical Laboratory Diagnostics). 2025; 70 (2): 135-140 (in Russ.).
DOI: https://doi.org/10.51620/0869-2084-2025-70-2-135-140
EDN: SQDAJV

Ключевые слова