Научно-практический журнал Клиническая лабораторная диагностика

АНАЛИЗ ПАТОГЕННОГО ПОТЕНЦИАЛА KLEBSIELLA PNEUMONIAE С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ПОЛНОГЕНОМНОГО СЕКВЕНИРОВАНИЯ

Устюжанин А.В.Чистякова Г.Н.Ремизова И.И.

Doi: 10.51620/0869-2084-2025-70-12-892-897 EDN: QRCLQM ISSN: 0869-2084 (Print) ISSN: 2412-1320 (Online)

Купить
Аннотация Об авторах Список литературы Ключ. слова

Аннотация

Полногеномное секвенирование обеспечивает высокую точность и полноту информации о геноме бактериального штамма, включая структуру резистома и вирулома. Это делает его незаменимым в эпидемиологическом надзоре и при изучении механизмов патогенеза заболеваний и распространения инфекционных агентов на популяционном уровне.
Цель исследования — проведение сравнительного анализа генетических профилей факторов патогенности и устойчивости к антибиотикам у штаммов Klebsiella pneumoniae, выделенных из отделяемого цервикального канала женщин, с использованием полногеномного секвенирования.
Материал и методы. Выделены два штамма K. pneumoniae 993 и 242 из отделяемого цервикального канала беременной и небеременной женщин в апреле и мае 2024 года. Полногеномные нуклеотидные последовательности задепонированы в международной базе генетической информации GenBank под номерами: JBLIYI000000000 и JBOEIZ000000000, загружены на отечественную платформу «VGARus», под номерами niio000009 и niio000004.
Результаты. Штаммы 993 и 242 различались по нескольким параметрам. Они принадлежали к сиквенс-типам ST4060 и ST8131 и капсульному локусу KL30 и KL39. У штамма 993 обнаружены гены aadA2, strA/strB, blaCTX-M-15, blaSHV-11, qnrS1, dfrA12, sul1/sul2. У штамма 242 определены blaOXA-48, blaNDM-1, blaCTX-M-15, aac(6′)-Ib-cr, mph(A), catB3, OqxAB. Гены патогенности у обоих изолятов включали mrkA-J (кодируют фимбрии типа 3), у штамма 242 дополнительно выявлены rmpA2, ybtA-U, fyuA, iucABCD, что обеспечило более высокий индекс вирулентности (4 из 5 против 0).
Заключение. Полученные данные подчеркивают важность молекулярного мониторинга K. pneumoniae в перинатальных центрах. Наличие штаммов с высокой вирулентностью и множественной лекарственной устойчивостью в цервикальном канале женщин репродуктивного возраста может представлять риск развития инфекционной патологии как для нее самой, так и внутриутробного инфицирования плода, и новорожденного.

Annotation

Устюжанин А.В., Чистякова Г.Н., Ремизова И.И. Анализ патогенного потенциала Klebsiella pneumoniae с использованием полногеномного секвенирования. Клиническая лабораторная диагностика. 2025; 70 (12): 892-897
DOI: https://doi.org/10.51620/0869-2084-2025-70-12-892-897
EDN: QRCLQM

Для цитирования:

Whole genome sequencing provides highly accurate and complete information about the genome of a bacterial strain, including the structure of the resistome and virulome. This makes it indispensable in epidemiological surveillance and in studying the mechanisms of disease pathogenesis and the spread of infectious agents at the population level.
The aim of the study was to conduct a comparative analysis of the genetic profiles of pathogenicity factors and antibiotic resistance in Klebsiella pneumoniae strains isolated from the cervical canal discharge of women using whole genome sequencing.
Material and methods. Two strains of K. pneumoniae 993 and 242 were isolated from the cervical canal discharge of pregnant and non-pregnant women in April and May 2024. The whole-genome nucleotide sequences were deposited in the international database of genetic information GenBank under the numbers: JBLIYI000000000 and JBOEIZ000000000, and also uploaded to the domestic platform «VGARus» under the numbers niio000009 and niio000004.
Results. Strains 993 and 242 differed in several parameters. They belonged to the ST4060 and ST8131 sequence types and the KL30 and KL39 capsular locus. Strain 993 contained the following genes: aadA2, strA/strB, blaCTX-M-15, blaSHV-11, qnrS1, dfrA12, sul1/sul2. Strain 242 contained blaOXA-48, blaNDM-1, blaCTX-M-15, aac(6′)-Ib-cr, mph(A), catB3, OqxAB. Virulence genes in both isolates included mrkA-J (encode type 3 fimbriae), however, strain 242 additionally contained rmpA2, ybtA-U, fyuA, and iucABCD, which provided a higher virulence index (4 out of 5 versus 0).
Conclusion. The obtained data emphasize the importance of molecular monitoring of K. pneumoniae in perinatal centers. The presence of strains with high virulence and multiple resistance in the cervical canal of women of reproductive age may pose a risk of developing infectious pathology both for herself and for intrauterine infection of the fetus and newborn.
Key words: K. pneumonia; virulence; antibiotic resistance; whole genome sequencing

For citation:

Ustyuzhanin A.V., Chistyakova G.N., Remizova I.I. Analysis of the pathogenic potential of Klebsiella pneumoniae using whole genome sequencing. Klinicheskaya Laboratornaya Diagnostika (Russian Clinical Laboratory Diagnostics). 2025; 70(12): 892-897 (in Russ.)
DOI: https://doi.org/ 10.51620/0869-2084-2025-70-12-892-897
EDN: QRCLQM