Аннотация
Муковисцидоз (МВ) — одно из частых моногенных заболеваний. В России проведение ДНК-диагностики при МВ необязательно, однако ее применение позволяет сократить время постановки диагноза, повысить эффективность терапевтического лечения и не допустить повторного появления заболевания в семье. ДНК-диагностика с использованием панелей на частые мутации в гене CFTR рекомендована в случаях неопределенной клинической картины и при пограничных значениях специфических лабораторных показателей. С помощью таких панелей в России удается выявить до 90% патологических аллелей в гене CFTR. Для выявления более редких аллелей традиционно проводят секвенирование по Сенгеру. В последнее время для выявления редких мутаций стали доступны методы высокопроизводительного секвенирования (MPS). В данной работе проведена оценка эффективности применения тест-системы на основе технологии таргетного секвенирования для выявления мутаций, не идентифицированных при первичной ДНК-диагностике. Кроме того, у двух пациентов с МВ методом MPS идентифицированы ранее не известные нонсенс-мутации Q1038X (c.3112C>T) и W1310X (c.3930G>A).
Об авторах
Павлов Александр ЕвгеньевичООО «ПАРСЕК ЛАБ» 199034, Санкт-Петербург, Россия генеральный директор ООО «ПАРСЕК ЛАБ», 199034, Санкт-Петербург apavlov@parseq.pro
Список литературы
Шерман В.Д., Каширская Н.Ю., Капранов Н.И., Кусова З.А. К вопросу о неонатальном скрининге на муковисцидоз в РФ. В кн.: Сборник тезисов: X Национальный конгресс “Муковисцидоз у детей и взрослых. 20 лет Российскому центру муковисцидоза”. Ярославль; 2011: 26-31
Castellani C., Cuppens H., Macek M.Jr., Cassiman J.J., Kerem E., Durie P. et al. Consensus on the use and interpretation of cystic fibrosis mutation analysis in clinical practice. J. Cyst. Fibros. 2008; 7 (3): 179-96.
Eshaque B., Dixon B. Technology platforms for molecular diagnosis of cystic fibrosis. Biotechnol. Adv. 2006; 24 (1): 86-93.
Lefterova M.I., Shen P., Odegaard J.I., Fung E., Chiang T., Peng G. et al. Next-generation molecular testing of newborn dried blood spots for cystic fibrosis. J. Mol. Diagn. 2016; 18 (2): 267-82.
Kulkarni S., Pfeifer J. Clinical Genomics: A Guide to Clinical Next Generation Sequencing. London: Elsevier Inc., Academic Press; 2015.
Симакова Т.С., Брагин А.Г., Зайцева М.А., Павлов А.Е. Роль высокопроизводительного секвенирования в неонатальном скрининге наследственных нарушений обмена веществ. Медицинская генетика. 2013; 12 (9): 11-3.
Петрова Н.В. Молекулярно-генетические и клинико-генотипические особенности муковисцидоза в российских популяциях: Автореф. дисс. … докт. биол. наук. М.; 2009.
Richards S., Aziz N., Bale S., Bick D., Das S., Gastier-Foster J. et al. Standards and guidelines for the interpretation of sequence variants: a joint consensus recommendation of the American College of Medical Genetics and Genomics and the Association for Molecular Pathology. Genet. Med. 2015; 17 (5): 405-24
Регистр больных муковисцидозом в Российской Федерации. 2013 год. М.: ИД «Медпрактика-м»; 2015.
Руковичкин Д.В. Клинико-генотипический полиморфизм муковисцидоза среди населения Краснодарского края: Дисс. … канд. мед. наук. Краснодар; 2007.
Петрова Н.В., Васильева Т.А., Тимковская Е.Е., Капранов Н.И., Зинченко Р.А. Анализ редких мутантных аллелей в гене CFTR у российских больных. В кн.: Сборник тезисов: XI Национальный конгресс “Муковисцидоз у детей и взрослых. Взгляд в будущее». М.; 2013: 66-9.
Férec C., Casals T., Chuzhanova N., Macek M.Jr., Bienvenu T., Holubova A. et al. Gross genomic rearrangements involving deletions in the CFTR gene: characterization of six new events from a large cohort of hitherto unidentified cystic fibrosis chromosomes and meta-analysis of the underlying mechanisms. Eur. J. Hum. Genet. 2006; 14 (5): 567-76.
Merlo C.A., Boyle M.P. Modifier genes in cystic fibrosis lung disease. J. Lab. Clin. Med. 2003; 141 (4): 237-41.
Chen R., Shi L., Hakenberg J., Naughton B., Sklar P., Zhang J. et al. Analysis of 589,306 genomes identifies individuals resilient to severe Mendelian childhood diseases. Nat. Biotechnol. 2016; 34 (5): 531-8.
Cohen-Cymberknoh M., Simanovsky N., Hiller N., Gileles-Hillel A., Shoseyov D., Kerem E. Differences in disease expression between primary ciliary dyskinesia and cystic fibrosis with and without pancreatic insufficiency. Chest. 2014; 145 (4): 738-44.