Аннотация
Развитие молекулярных методов исследований в конце XX века позволило расширить номенклатуру видов, образующих род Staphylococcus, который в настоящее время насчитывает 51 вид и 27 подвидов. Патогенные виды рода обладают способностью коагулировать плазму крови млекопитающих, образуя группу коагулазопозитивных стафилококков (КПС), включающую 7 видов: S. aureus, S. delphini, S. intermedius, S. pseudintermedius, S. lutrae, S. schleiferi ssp. coagulans, S. hyicus. В клинической практике наиболее вирулентным среди стафилококков считается S. aureus. Накопленные данные свидетельствуют о возрастающей этиологической значимости в инфекционной патологии человека и животных других представителей группы КПС. Пристального внимания заслуживают Staphylococcus intermedius группы (SIG), объединяющей три близкородственных вида: S. pseudintermedius, S. intermedius, S. delphini, среди которых наиболее широкое распространение получили метициллинустойчивые клоны S. pseudintermedius, способные вызывать различные гнойно-воспалительные заболевания у человека. Лабораторные методы, основанные на фенотипических тестах, не позволяют дифференцировать КПС из-за значительного сходства фенотипических свойств у некоторых представителей этой группы. Проведён сравнительный анализ эффективности различных методов видовой идентификации КПС: биохимического, молекулярно-генетических (мультипраймерная ПЦР (М-ПЦР) для идентификации различий структуры гена термонуклеазы, анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов (ПДРФ) гена каталазы и их секвенирование), матрично-активированная лазерная десорбционная/ионизационная времяпролетная масс-спектрометрия (MALDI-ToF MS) с различными способами пробоподготовки. Исследовано 117 изолятов представителей SIG, выделенных от больных и здоровых особей мелких домашних животных, клинические изоляты от пациентов стационаров. М-ПЦР позволила идентифицировать 97% изолятов, ПДРФ-анализ — 100% изолятов, что подтверждает эффективность молекулярно-генетических методов исследования. MALDI-ToF MS требует пополнения базы данных масс-спектрометра и использование способа предварительной белковой экстракции проб для повышения эффективности видовой идентификации КПС.
Список литературы
Lowy F.D. Staphylococcus aureus infections. N. Engl. J. Med. 1998; 339: 520-32.
Grundmann H., Aanensen D.M., van den Wijngaard C.C., Spratt B.G., Harmsen D., Friedrich A.W. et al. Geographic distribution of Staphylococcus aureus causing invasive infections in Europe: a molecular-epidemiological analysis. PLoS Med. 2010; 7(1): e1000215.
Hajek V. Staphylococcus intermedius, a new species isolated from animals. Int. J. Syst. Bacteriol. 1976; 26(4): 401-8.
Varaldo P.E., Kilpper-Baelz R., Biavasco F., Satta G., Schleifer K. Staphylococcus delphini sp. nov., a coagulase-positive species isolated from dolphins. Int. J. of Syst. Bact. 1988; 38: 436-9.
Devriese L.A., Hajek V., Oeding P., Meyer S.A., Schleifer K.H. Staphylococcus hyicus comb. nov. and Staphylococcus hyicus subsp. chromogenes subsp. nov. Intern. J. Syst. Bacteriol. 1978; 28: 482-90.
Igimi S., Takahashi E., Mitsuoka T. Staphylococcus schleiferi subsp. coagulans subsp. nov., isolated from the external auditory meatus of dogs with external ear otitis. Int. J. Syst. Bacteriol. 1990; 40: 409-11.
Devriese L.A., Vancanneyt M., Baele M., Vaneechoutte M., De Graef E., Snauwaert C. et al. Staphylococcus pseudintermedius sp. nov., a coagulase-positive species from animals. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2005; 55: 1569-73.
Foster G., Ross H.M., Hutson R.A., Collins M.D. Staphylococcus lutrae sp. nov., a new coagulase-positive species isolated from otters. Int. J. Syst. Bacteriol. 1997; 65: 1571-8.
Sasaki T., Takahashi N., Kamata S., Hiramatsu K. Reclassification of phenotypically identified Staphylococcus intermedius strains. J. Clin. Microbiol. 2007; 45(9): 2770-8.
Дмитренко О.А., Балбуцкая А.А., Скворцов В.Н. Особенности экологии, патогенные свойства и роль представителей группы Staphylococcus intermedius в инфекционной патологии животных и человека. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2016; 34(3): 4-11
Starlander G., Börjesson S., Grönlund-Andersson U., Tellgren-Roth C., Melhus A. Cluster of infections caused by methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius in humans in a tertiary hospital. J. Clin. Microbiol. 2014; 52(8): 3118-20.
Durdik P., Fedor M., Jesenak M., Hamzikova J., Knotkova H., Banovcin P. Staphylococcus intermedius — rare pathogen of acute meningitis. Int. J. Infect. Dis. 2010; 14: 236-8.
Kelesidis T., Tsiodras S. Staphylococcus intermedius is not only a zoonotic pathogen, but may also cause skin abscesses in humans after exposure to saliva. Int. J. Infect. Dis. 2010; 14: 838-41.
Somayaji R., Priyantha M.A., Rubin J.E., Church D. Human infections due to Staphylococcus pseudintermedius, an emerging zoonosis of canine origin: report of 24 cases. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2016; 85(4): 471-6.
Guardabassi L., Loeber M.E., Jacobson A. Transmission of multiple antimicrobial-resistant Staphylococcus intermedius between dogs affected by deep pyoderma and their owners. Veterinary Microbiology. 2004; 98: 23-7.
Khambarty F.M., Bennett R.W., Shah D.B. Application of pulsed-gel electrophoresis to the epidemiological characterization of Staphylococcus intermedius implicated in a food-related outbreak. Epidemiol. Infect. 1994; 113: 75-81.
Martins P.D., de Almeida T.T., Basso A.P., de Moura T.M., Frazzon J., Tondo E.C. et al. Coagulase-positive staphylococci isolated from chicken meat: pathogenic potential and vancomycin resistance. Foodborne Pathog. Dis. 2013; 10: 771-6.
Al-Tarazi Y.H., Albetar M.A., Alaboudi A.R. Biotyping and enterotoxigenicity of staphylococci isolated from fresh and frozen meat marketed in Jordan. Food Research International. 2009; 42: 374-9.
Воробьёва О.Н., Денисенко Л.И., Жилина Н.М. Этиология гнойно-септических процессов у ожоговых больных. Бюллетень СО РАМН. 2010; 30 (6): 57-63.
Акопова И.С., Коленчукова О.А. Науки о человеке: Некоторые особенности внутрибольничных штаммов микроорганизмов рода Staphylococcus. Томск: СГМУ; 2002: 4-5.
Гордина Е.М., Горовиц Э.С., Поспелова С.В., Афанасьевская Е.В. Видовой спектр и биологические свойства стафилококков, изолированных от птиц, в условиях крупной птицефабрики. Медицинский альманах. 2014; 2(32): 84-7.
Ben Zakour N.L., Beatson S.A., van den Broek A.H., Thoday K.L., Fitzgerald J.R. Comparative genomic study of the Staphylococcus intermedius group of animal pathogens. Frontiers in Cellular and Infection Microbiology. 2012; 2: 1-15.
Perreten V., Kadlec K., Schwarz S., Grönlund Andersson U., Finn M., Greko C. et al. Clonal spread of methicillin-resistant Staphylococcus pseudintermedius in Europe and North America: an international multicentre study. J. Antimicrob. Chemother. 2010; 65(5): 1145-54.
Performance Standards for Antimicrobial Disk and Dilution Susceptibility Tests for Bacteria Isolated From Animals; Approved Standard — Third Edition. CLSI document M31-А3. 2010; 28(8).
Sasaki T., Tsubakishita S., Tanaka Y., Sakusabe A., Ohtsuka M., Hirotaki S. Multiplex-PCR method for species identification of coagulase-positive staphylococcoci. J. Clin. Microbiol. 2010; 48(3): 765-9.
Blaiotta G., Fusco V., Ercolini D., Pepe O., Coppola S. Diversity of Staphylococcus species strains based on partial kat (catalase) gene sequences and design of a PCR-restriction fragment length polymorphism assay for identification and differentiation of coagulase-positive species (S. aureus, S. delphini, S. hyicus, S. intermedius, S. pseudintermedius, and S. schleiferi subsp. coagulans). J. Clin. Microbiol. 2010; 48(1): 192-201.
Дмитренко О.А., Шагинян И.А., Гинцбург А.Л. Исследование полиморфизма mec ДНКуметициллинрезистетных штаммов золотистого стафилококка, выделенных в стационарах разных регионов России. Молекулярная генетика, микробиология, и вирусология. 2005; 3: 11-7
Woo P.C., Teng J.L., Wu J.K., Leung F.P., Tse H., Fung A.M. et al. Guidelines for interpretation of 16S rRNA gene sequence-based results for identification of medically important aerobic Gram-positive bacteria. J. Med. Microbiol. 2009; 58(8): 1030-6.
Yugueros J., Temprano A., Berzal B., Sánchez M., Hernanz C., Luengo J.M. et al. Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-encoding gene as a useful taxonomic tool for Staphylococcus spp. J. Clin. Microbiol. 2000; 38(12): 4351-5.
Murugaiyan J., Walther B., Stamm I., Abou-Elnaga Y., Brueggemann-Schwarze S., Vincze S. et al. Species differentiation within the Staphylococcus intermedius group using a refined MALDI-ToF MS database. Clin. Microbiol. Infect. 2014; 20(10): 1007-15.