Аннотация
Изучена эффективность использования тест-системы «ВыборАнтибиотика» для выращивания максимально возможного количества бактерий из патологического материала при пневмонии. По результатам метагеномного анализа установлено, что тест-система позволяет поддержать рост практически всех бактерий, выявленных в мокроте, в том числе тех, которые относятся к пока не культивируемым. Проведено сравнение результатов стандартного определения чувствительности бактерий к антибиотикам и выбора эффективного лекарственного препарата по результатам использования тест-системы «ВыборАнтибиотика». Полученные данные показывают, что тест-система позволяет без выделения чистой культуры выбрать антибиотик в течение 6-20 ч.
Об авторах
Тец Виктор ВениаминовичГБОУ ВПО «Первый Санкт-Петербургский государственный медицинский университет им. акад. И.П. Павлова» Минздрава РФ 197022, Санкт-Петербург, Российская Федерация ст. науч. сотрудник vtetzv@yahoo.com
Список литературы
Jorgensen J.H., Ferraro M.J. Antimicrobial Susceptibility Testing: A Review of General Principles and Contemporary Practices. Clin. Infect. Dis. 2009; 49(11): 1749-55.
Вечерковская М.Ф., Тец Г.В., Тец В.В. Неизвестные бактерии в микрофлоре ротовой полости детей с онкогематологическими заболеваниями. Клиническая онкогематология. 2014; 7(2): 229-32.
Grice E.A., Segre J.A. The Human Microbiome: our second genome. Annu. Rev. Genomics Hum. Genet. 2012; 13: 151-70.
Oliver J.D. Recent findings on the viable but nonculturable state in pathogenic bacteria. FEMS Microbiol. Rev. 2010; 34: 415-25.
Lipkin W.I. The changing face of pathogen discovery and surveillance. Nat. Rev. Microbiol. 2013; 11: 133-41.
Petrosino J.F., Highlander S., Luna R.A., Gibbs R.A., Versalovic J. Metagenomic pyrosequencing and microbial identification. Clin. Chem. 2009; 55(5): 856-66.
Schloss P., Westcott S.L., Ryabin T., Hall J.R., Hartmann M., Hollister E.B. et al. Introducing mothur: open-source, platform-independent, community-supported software for describing and comparing microbial communities. Appl. Environ. Microbiol. 2009; 75(23): 7537-41.
Suwantarat N., Adams L.L., Romagnoli M., Carroll K.C. Fatal case of Herbaspirillum seropedicae bacteremia secondary to pneumonia in an end-stage renal disease patient with multiple myeloma. Diagn. Microbiol. Infect. Dis. 2015; 82(4): 331-3. Available online DOI: https://dx.doi.org/10.1016/j.diagmicrobio.2015.04.011
De Baets F., Schelstraete P., Van Daele S., Haerynck F., Vaneechoutte M. Achromobacter xylosoxidans in cystic fibrosis: prevalence and clinical relevance. J. Cyst. Fibros. 2007; 6: 75-8.
Aundhakar S.C., Mane M.B., Bharadiva, Pawar S.K. Watch Out! Pneumonia Secondary to Achromobacter Denitrificans. Ann. Med. Health. Sci. Res. 2014; 4(1): S22-4.
Farr G., Pedram S. Community-Acquired Pneumonia with Sphingomonas paucimobilis. Chest. 2013; 10: 144. DOI: 10.1378/chest.1703090
Liao C.H., Teng L.J., Hsueh P.R., Chen Y.C., Huang L.M., Chang S.C. Nutritionally variant streptococcal infections at a University Hospital in Taiwan: disease emergence and high prevalence of beta-lactam and macrolide resistance. Clin. Infect. Dis., 2004; 38: 452-55.
Tarr P.E., Stock F., Cooke R.H., Fedorko D.P., Lucey D.R. Multidrug-resistant Corynebacterium striatumpneumonia in a heart transplant recipient. Transpl. Infect. Dis. 2003; 5(1): 53-8.