МЕТОДИЧЕСКИЕ ОСОБЕННОСТИ ОПРЕДЕЛЕНИЯ ЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ ШТАММОВ SALMONELLA К АНТИМИКРОБНЫМ ПРЕПАРАТАМ (OБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ)

Аннотация

Бактерии рода Salmonella являются ведущими возбудителями инфекций, передающихся пищевым путём: ежегодно в Российской Федерации регистрируют около 50 тыс. случаев сальмонеллёзов. Антимикробная терапия рекомендована в случае тяжёлого течения заболевания у детей до 6 лет и лиц старше 50 лет, у пациентов с тяжёлыми сопутствующими состояниями, в случае генерализации инфекции. Бета-лактамные антибиотики, хинолоны, азитромицин входят в перечень препаратов, рекомендуемых для лечения сальмонеллёзов, включая брюшной тиф. Эффективность терапии во многом зависит от правильного определения чувствительности штамма к антибиотикам: выбора метода тестирования, индикаторных препаратов и интерпретации полученных результатов. Род Salmonella относится к семейству Enterobacteriacae и характеризуется общими для энтеробактерий механизмами резистентности к хинолонам и бета-лактамам, но оценка чувствительности штаммов Salmonella к антибиотикам этих групп имеет ряд особенностей. В статье представлены современные данные о чувствительности штаммов Salmonella, включая возбудителя брюшного тифа Salmonella Typhi, к антимикробным препаратам и ведущих клинически значимых механизмах резистентности. Подробно описаны методические особенности определения чувствительности штаммов Salmonella к антибиотикам, применяемым для лечения сальмонеллёзов (хинолонам, бета-лактамам, азитромицину). Представлены особенности интерпретации результатов тестирования штаммов Salmonella с позиций современных международных и российских рекомендаций. Представлены алгоритмы определения чувствительности Salmonella к хинолонам, цефалоспоринам, карбапенемам, критерии интерпретации результатов, позволяющие проводить детекцию клинически значимых механизмов резистентности к бета-лактамам (продукция бета-лактамаз различных молекулярных классов), хинолонам (хромосомные мутации и приобретённые гены резистентности).

Об авторах

Список литературы

The European Union summary report on trends and sources of zoonoses, zoonotic agents and food-borne outbreaks in 2016. EFSA Journal. 2017; 15(12): 5077.

Sirinavin S., Garner P. Antibiotics for treating Salmonella gut infections. Cochrane Database Syst. Rev. 2000; 2: CD001167.

Crump J.A., Sjölund-Karlsson M., Gordon M.A., Parry C.M. Epidemiology, clinical presentation, laboratory diagnosis, antimicrobial resistance, and antimicrobial management of invasive Salmonella infections. Clin. Microbiol. Rev. 2015; 28 (4): 901-37.

Riddle M.S., DuPont H.L., Bradley A. Connor B.A. ACG Clinical Guideline: Diagnosis, Treatment, and Prevention of Acute Diarrheal Infections in Adults. Am. J. Gastroenterol. 2016; 111: 602-22.

Клинические рекомендации (протокол ведения) «Сальмонеллез у взрослых». ФГБУ ВПО «Дагестанская государственная медицинская академия» МЗ РФ, ФГБУ «НИИ гриппа» МЗ России. Available at: https://nnoi.ru/uploads/files/Salmonelles.pdf

Клинические рекомендации (протокол лечения) оказания медицинской помощи детям, больным сальмонеллезом. ФГБУ НИИДИ ФМБА России. Утв. 09.10.2013. Available at: https://niidi.ru/dotAsset/6501246b-27f5-4d17-964d-7dc4defb8b43.pdf

Guarino A., Ashkenazi S., Gendrel D., Vecchio A.L., Shamir R., Szajewskaеt H. European Society for Pediatric Gastroenterology, Hepatology, and Nutrition/ European Society for Pediatric Infectious Diseases evidence-based guidelines for the management of acute gastroenteritis in children in Europe: update 2014. J. Pediatr. Gastroenterol. Nutr. 2014; 59(1): 132-52.

Centers for Disease Control and Prevention. Yellow Book, 2017, Chapter 2. Travelers’ Diarrhea. Available from https://wwwnc.cdc.gov/travel/yellowbook/2018/the-pre-travel-consultation/travelersdiarrhea.

The European Summary Report on antimicrobial resistance in zoonotic and indicator bacteria from humans, animals and food in 2016. European Food Safety Authority and European Centre for Disease Prevention and Control. EFSA Journal. 2016; 2:5182.

Милютина Л.Н., Гурьева О.В. Эволюция лекарственной резистентности сальмонелл, выделенных от детей, и ее клиническая значимость. Лаборатория. 2011; 3: 5-7

Egorova S., Kaftyreva L., Grimont P.A.D, Weill F-X. Prevalence and characterization of extended-spectrum cephalosporin resistant non-typhoidal Salmonella isolates in adults in St-Petersburg, Russia (2002-2005). Microbial Drug Resistance. 2007; 13(2):102-7

Гончар Н.В., Лазарева И.В., Рычкова С.В., Кветная А.С., Альшаник Л.П., Фомичева Ю.В. и др. Заболеваемость детей сальмонеллезом и уровень резистентности клинических штаммов сальмонелл к антибактериальным препаратам в Санкт-Петербурге. Журнал инфектологии. 2015; 7(1): 80-6.

Жирнова Л.Ю., Уткина Н.П., Сихандо Л.Ю., Пеленко Т.Ф., Егорова С.А., Кафтырева Л.А. и др. Чувствительность к антимикробным препаратам штаммов Salmonella, выделенных в Санкт-Петербурге в 2014-2015 гг. Инфекция и иммунитет. 2016; 6(3): 27.

Клинические рекомендации «Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам». Available at: https://www.antibiotic.ru/minzdrav/files/docs/clrec-dsma2015.pdf

Piddock LJ. Fluoroquinolone resistance in Salmonella serovars isolated from humans and food animals. FEMS Microbiol. Rev. 2002; 26: 3-16.

Crump J.A., Kretsinger K., Gay K. Clinical response and outcome of infection with Salmonella enterica serotype Typhi with decreased susceptibility to fluoroquinolones: a United States FoodNet multicentre retrospective study. Antimicrob. Agents Chemother. 2008; 52: 1278-84.

Parry C.M., Ho V.A, Phuong L.T., Van Be Bay P., Lanh M.N., Tung L.T. et al. Randomized controlled comparison of ofloxacin, azithromycin, and an ofloxacin-azithromycin combination for treatment of multidrug-resistant and nalidixic acid-resistant typhoid fever. Antimicrob Agents Chemother. 2007; 51: 819-25.

Dolecek C., Phi La T.T., Rang N.N., Phuong L.T., Vinh H., Tuane P.Q. et al. A Multi-Center Randomised Controlled Trial of Gatifloxacin versus Azithromycin for the Treatment of Uncomplicated Typhoid Fever in Children and Adults in Vietnam. PLoS ONE. 2008; 3(5): e2188.

Thompson C.N., Karkey A., Dongol S., Arjyal A., Wolbers M., Darton T. et al. Treatment Response in Enteric Fever in an Era of Increasing Antimicrobial Resistance: An Individual Patient Data Analysis of 2092 Participants Enrolled into 4 Randomized, Controlled Trials in Nepal. Clin. Infect. Dis. 2017; 64 (11): 1522-1531.

European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing Breakpoint tables for interpretation of MICs and zone diameters. Available at: https://www.eucast.org/clinical_breakpoints

Кафтырева Л.А., Егорова С.А., Макарова М.А., Тюленев С.В., Трифонова Г.Ф., Калинина О.В. Особенности резистентности к антимикробным препаратам возбудителя брюшного тифа, зарегистрированного на территории Российской Федерации в 2005-2016 гг. Профилактическая и клиническая медицина. 2017; 2(63): 14-9

Rodriguez-Martinez J.M., Cano M.E., Velasco C., Martinez-Martinez L., Pascual A. Plasmid-mediated quinolone resistance: an update. J. Infect. Chemother. 2011; 17(2): 149-182.

CDC. National Antimicrobial Resistance Monitoring System for Enteric Bacteria (NARMS): Human Isolates Surveillance Report for 2015 (Final Report). Atlanta, Georgia: U.S. Department of Health and Human Services, CDC, 2018. Available at: https://www.cdc.gov/narms/pdf/2015-NARMS-Annual-Report-cleared_508.pdf

Canadian Integrated Program for Antimicrobial Resistance Surveillance (CIPARS) annual report, 2013. Available at: https://www.canada.ca/en/public-health/services/surveillance/canadian-integrated-program-antimicrobial-resistance-surveillance-cipars/cipars-2013-annual-report.html

Jeon H.Y., Kim Y.B., Lim S.K., Lee Y.J., Seo K.W. Characteristics of cephalosporin-resistant Salmonella isolates from poultry in Korea, 2010-2017. Poultry Science. 2019; 98(2): 957-965.

Козырева В.К., Эйдельштейн М.В., Тапальский Д.В., Азизов И.С., Романов А.В., Козлов Р.С. Клональное распространение СТХ-М-5-продуцирующих нозокомиальных штаммов Salmonella Typhimurium в России, Беларуси и Казахстане. Клиническая Микробиология и Антимикробная Химиотерапия. 2012;14(1): 38-50.

Егорова С.А., Кафтырева Л.А., Войтенкова Е.В., Смирнова Е.В., Толузакова Н.В., Черткова С.А. Механизмы резистентности к фторхинолонам и цефалоспоринам штаммов Salmonella, выделенных в Санкт-Петербурге в 2014-2016 гг. Инфекция и иммунитет. 2016; 6(3): 23.

Parry C.M, Thieu N.T.V., Dolecek C., Karkey A., Gupta R., Turner P. et al. Clinically and microbiologically derived azithromycin susceptibility breakpoints for Salmonella enterica serovars Typhi and Paratyphi A. Antimicrob. Agents Chemother. 2015; 59:2756-64.

Kuijpers L.M.F., Phe T., Veng C.H., Lim K., Ieng S., Kham C. et al. The clinical and microbiological characteristics of enteric fever in Cambodia, 2008-2015. PLoS Negl. Trop. Dis. 2017; 11(9): e0005964.

Hendriksen R.S., Leekitcharoenphon P., Mikoleit M., Jensen J.D., Kaas R.S., Roer L. et al. Genomic dissection of travel-associated extended-spectrum-beta-lactamase-producing Salmonella enterica serovar Typhi isolates originating from the Philippines: a one-off occurrence or a threat to effective treatment of typhoid fever? J. Clin. Microbiol. 2015; 53(2): 677-80.

Gul D., Potter R.F., Riaz H., Ashraf S.T., Wallace M.A., Munir T. et al. Draft genome sequence of a Salmonella enterica serovar Typhi strain resistant to fourth-generation cephalosporin and fluoroquinolone antibiotics. Genome Announc. 2017; 5:e00850-17.

Akinyemi K.O., Iwalokun B.A., Alafe O.O., Mudashiru S.A., Fakorede C. bla CTX-M-I group extended spectrum beta lactamase-producing Salmonella Typhi from hospitalized patients in Lagos, Nigeria. Infect. Drug. Resist. 2015; 11(8): 99-106.

Akinyemi K.O., Iwalokun B.A., Oyefolu A.O., Fakorede C.O. Occurrence of extended-spectrum and AmpC β-lactamases in multiple drug resistant Salmonella isolates from clinical samples in Lagos, Nigeria. Infect. Drug Resist. 2017; 10:19-25.

Ahamed Riyaaz A.A., Perera V., Sivakumaran S., de Silva N. Typhoid Fever due to Extended Spectrum β-Lactamase-Producing Salmonella enterica Serovar Typhi: A Case Report and Literature Review. Case Reports in Infectious Diseases. 2018; Article ID 4610246.

Ramachandran A., Shanthi M., Sekar U. Detection of blaCTX-M Extended Spectrum Beta-lactamase Producing Salmonella enterica Serotype Typhi in a Tertiary Care Centre. J. Clin. Diagn. Res. 2017; 11(9): DC21-DC24.

The EUCAST guideline on detection of resistance mechanisms v 2.0 (2017-07-11). Available at: https://www.eucast.org/resistance_mechanisms

Fernández J., Guerra B., Rodicio M.R. Resistance to Carbapenems in Non-Typhoidal Salmonella enterica Serovars from Humans, Animals and Food. Veterinary sciences. 2018; 5(2): 40.

Effa E.E., Bukirwa H. Azithromycin for treating uncomplicated typhoid and paratyphoid fever (enteric fever). Cochrane Database Syst. Rev. 2011;5(10): CD006083.

Ключевые слова