Аннотация
С использованием современного метода идентификации микроорганизмов MALDI-TOF масс-спектрометрического анализа проведено исследование выборки штаммов Y. pestis основного и алтайского подвидов. Выполнена оценка биологической безопасности метода пробоподготовки, для пополнения идентификационной базы BioTyper получены спектры типовых штаммов Y. pestis. Расширенную идентификационную базу использовали для оценки возможности применения технологии MALDI-TOF для идентификации и таксономической дифференциации Y. pestis от других представителей рода Yersinia. При исследовании наблюдалось полное соответствие результатов масс-спектрометрической идентификации и классического культурального метода. На основании масс-спектрометрической характеристики исследуемой выборки удалось провести дифференциацию штаммов Y. pestis подвида pestis от штаммов подвида altaica. Полученные результаты свидетельствуют об эффективности применения масс-спектрометрического анализа для достоверной меж- и внутривидовой дифференциации возбудителя чумы. Простота и скорость пробоподготовки и выполнения анализа, низкая стоимость расходных материалов позволяют рассматривать метод MALDI-TOF масс-спектрометрической идентификации как весьма перспективный для лабораторной диагностики возбудителя чумы.
Об авторах
Афанасьев Максим ВладимировичФКУЗ Иркутский научно-исследовательский противочумный институт Роспотребнадзора 664047, Иркутск, ул. Трилиссера, 78 канд. биол. наук, вед. науч. сотр. afanasev_max@mail.ru
Список литературы
Онищенко Г.Г., ред. Природные очаги чумы Кавказа, Прикаспия, Средней Азии и Сибири. М.: Медицина; 2004.
Балахонов С.В. Геномные маркеры возбудителей чумы, псевдотуберкулеза, холеры, бруцеллеза: автореф. дисс.. д-ра мед. наук. Иркутск; 2000.
Афанасьев М.В., Чипанин Е.В., Шестаков В.Е., Денисов А.В., Фомина Л.А., Остяк А.С. и др. Разработка и использование ПЦР-системы в режиме реального времени для детекции Yersinia pestis в полевом материале. Клиническая лабораторная диагностика. 2013; 3: 38-41.
Chase C.J., Ulrich M.P., Wasieloski L.P. Jr., Kondig J.P., Garrison J., Lindler L.E. et al. Real-time PCR assays targeting a unique chromosomal sequence of Yersinia pestis. Clin. Chem. 2005; 51: 1778-85.
Radnedge L., Chin S.G., Mccready P.M. Worsham P.L., Andersen G.L. Identification of nucleotide sequences for the specific and rapid detection of Yersinia pestis. Appl. Environ. Microbiol. 2001; 67: 3759-62.
Zhou D., Han Y., Dai E., Pei D., song Y., Zhai J. et al. Identification of signature genes for rapid and specific characterization of Yersinia pestis. Microbiol. Immunol. 2004; 48: 263-9.
Seng P., Drancourt M., Gouriet F., La Scola B., Fournier P.E., Rolain J.M. et al. Ongoing revolution in bacteriology: routine identification of bacteria by matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry. Clin. Infect. Dis. 2009; 49 (4): 552-3.
Karas M., Bahr U. Laser desorption ionization mass spectrometry of large biomolecules. Trends Anal. Chem. 1990; 9 (10): 321-5.