ЭТИОЛОГИЯ ГНОЙНО-ВОСПАЛИТЕЛЬНЫХ ПРОЦЕССОВ В ГЕНИТАЛЬНОМ ТРАКТЕ: ПОДОЗРЕНИЯ КЛИНИЦИСТОВ И ПРОБЛЕМЫ ЛАБОРАТОРНОГО ПОДТВЕРЖДЕНИЯ
ISSN: 0869-2084 (Print) ISSN: 2412-1320 (Online)
Аннотация
Несмотря на многолетнюю историю изучения, лабораторная диагностика гонококковой инфекции остается сложной задачей, не имеющей чётко регламентированного эффективного решения. Цель исследования — оценка видового разнообразия микробиоты генитального тракта мужчин и женщин с подозрениями на острую генитальную гонококковую инфекцию (ОГГИ) с использованием тест-систем отечественных производителей. Проведено исследование образцов содержимого уретры 69 мужчин и отделяемого заднего свода влагалища 33 женщин репродуктивного возраста с характерными клиническими проявлениями и предположительным диагнозом ОГГИ. Культуральное исследование осуществляли с использованием элективных питательных сред с последующей идентификацией культур по биохимическим свойствам. Обнаружение ДНК Neisseria gonorrhoeae, Staphylococcus spp., Streptococcus spp., Enterobacteriaceae, Gardnerella vaginalis, Atopobium vaginae, Lactobacillus spp. выполняли методом ПЦР с помощью наборов Вектор-Бест и ИнтерЛаб Сервис (Россия). Пациенты разделены на группы согласно результатам бактериологического метода и ПЦР. Метагеномное исследование 16S рибосомальной РНК образцов осуществлено на платформе Illumina MiSeq, с использованием набора MiSeq Reagent Kits v3 (600-Cycle Kit). Статистический анализ данных проводили с помощью критерия х2. В результате лабораторного исследования предположительный клинический диагноз «ОГГИ» нашёл своё бактериологическое подтверждение лишь в 35,3% случаев, среди которых фрагменты генома N. gonorrhoeae детектированы лишь в 63,9% образцов. При этом в метагеномном анализе установлено широкое разнообразие микроорганизмов в генитальном тракте, как мужчин, так и женщин. Данная методика не позволяет оценить жизнеспособность обнаруженных бактерий, спектр микрофлоры избыточно широк, высокий уровень генетического полиморфизма разных штаммов N. gonorrhoeae затрудняют интерпретацию полученных результатов. Расшифровать состав микробиоты позволяет использование тест-систем ИнтерЛаб Сервис. Расшифровку этиологии гнойно-воспалительных процессов в генитальном тракте, представляющую серьёзные трудности, в значительной степени облегчает применение отечественных тест-систем для молекулярно-генетического анализа, позволяющих получить необходимую и достаточную для практики информацию.