Научно-практический журнал Клиническая лабораторная диагностика

ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКИЕ ГРУППЫ И ГЕНЫ ВИРУЛЕНТНОСТИ ШТАММОВ ESCHERICHIA COLI, ВЫДЕЛЕННЫХ ИЗ МИКРОБИОТЫ КИШЕЧНИКА ДЕТЕЙ

Макарова Мария АлександровнаСужаева Людмила Валерьевна

ISSN: 0869-2084 (Print) ISSN: 2412-1320 (Online)

Купить
Аннотация Об авторах Список литературы Ключ. слова

Аннотация

Вид Escherichia coli характеризуется широким внутривидовым разнообразием. Среди представителей вида присутствуют как комменсалы, так и патогены, вызывающие диареи и заболевания внекишечной локализации. Патогенные штаммы отличаются от непатогенных наличием факторов вирулентности и кодирующих их генов. Филогенетическая структура вида представлена четырьмя основными группами (А, В1, В2, D), распространенность которых отличается у жителей различных географических регионов. Патогенные представители вида давно и подробно изучаются, в то время как непатогенным штаммам не уделялось такое внимание. В статье представлены результаты исследования 511 штаммов E. coli, выделенных из микробиоты кишечника детей без диареи и инфекций мочевыводящих путей, в возрасте от 1 мес до 17 лет, проживающих в Санкт-Петербурге. Методом ПЦР определены основные филогенетические группы, выявлены гены вирулентности E. coli, ассоциированные с диареей и заболеваниями внекишечной локализации. Результаты: Структура популяции E. coli представлена следующими группами: А — 33,3%, В1 — 6,7%, В2 — 34,0%, D — 26%. В исследуемой популяции выявлено EPEC — 2,5%, EAggEC — 4,5% штаммов. Гены вирулентности EPEC чаще выявлялись у штаммов филогруппы В1, гены вирулентности EAggEC — у изолятов филогруппы D. Распространенность генов внекишечной вирулентности была следующей: pap — 29,5%; sfa — 19,8%; afa — 3,3%; hly — 20,9%; cnf — 17,4%; aer — 20,0%. Гены pap, sfa, hly, cnf были наиболее характерны для E. coli филогенетической группы В2. Выявлено сходство структуры исследуемой популяции E. coli по филогенетическим группам с популяциями E. coli жителей Парижа и Сиднея. Анализ распространенности генов вирулентности показал зависимость их наличия от генетического фона микроорганизма.