Аннотация
Метод масс-спектрометрии микробных маркеров (МСММ) известен 20 лет. Он описан в ряде научных публикаций, диссертациях и методической литературе, прошел регистрацию в Росздравнадзоре и разрешен к применению в качестве новой медицинской технологии в медицинских учреждениях на территории Российской Федерации (“Оценка микроэкологического статуса человека методом хромато-масс-спектрометрии», разрешение ФС № 2010/038 от 24.02.10). Метод МСММ только начал формироваться как инструмент клинического рутинного анализа и мониторинга микроэкологического статуса, инфекции и дисбиозов в клинической и амбулаторной практике. Описание технологии МСММ в таком аспекте требует иного, чем было сделано ранее, подхода к введению клинических лаборантов и врачей в метод. Подробно дается обоснование видовой специфичности состава жирных кислот и (жирных) альдегидов клеточной стенки микроорганизмов как основы их видовой дифференциации в чистой культуре. Объясняется выбор молекулярных маркеров для их детектирования в крови и другом клиническом материале с целью дальнейшей реконструкции состава микробного сообщества (микроэкологии) человека по крови или расчет состава микст-инфекции в органах по материалу из очага воспаления — моче, ликвору, мокроте, экссудату, дренажу и аналогичным пробам, содержащим химическую информацию о микробах.
Список литературы
Митрука Б.М. Применение газовой хроматографии в микробиологии и медицине. М.: Медицина; 1978.
Goodfellow M., Minnikin D., eds. Chemical Methods in Bacterial Systematics. London: Academic Press; 1985.
О’Лири В. Липиды микроорганизмов. В кн.: О’Лири В. Молекулярная микробиология. М.: Мир; 1977: 201-39.
Larsson L. Determination of microbial chemical markers by gas chromatography-mass-spectrometry potential for diagnosis and studies on metabolism in situ. APMIS. 1994; 102(3): 161-9.
Brondz J., Olsen J. Microbial chemotaxonomy. Chromatography, electrophoresis and relevant profiling techniques. J. Chromatogr. 1986; 379: 367-411.
Moss C.W., Dees S.R. Identification of microorganisms by gas chromatographic — mass spectrometric analysis of cellular fatty acids. J. Chromatogr. 1975; 112: 594-604.
Васюренко З.П., Фролов А.Ф., Смирнов В.В., Рубан Н.М. Жирнокислотные профили бактерий, патогенных для человека и животных. Киев: Наукова думка; 1992.
Поздоровкина В.В., Белобородова Н.В., Курчавов В.А., Бойко Н.Б., Рогатина Е.Л., Демина А.М. Газохроматографическая диагностика кандидоза и мониторинг эффективности противогрибковой терапии по уровню арабинитола и маннозы у детей. Антибиотики и химиотерапия. 1998; 16(5): 23-5.
Larsson L., Pehrson C., Wiebe T., Christensson B. Chromatographic determination of D-arabinitol/L-arabinitol ratios in urine: a potential method for diagnosis of disseminated candidiasis. J. Clin. Microbiol. 1994; 32(8): 1855-9.
Lehtonen L., Anttila V.J., Ruutu T., Salonen J., Nikoskelainen J., Eerola E. et al. Diagnosis of disseminated candidiasis by measurement of urine D-arabinitol/I-arabinitol ratio. J. Clin. Microbiol. 1996; 34(9): 2175-9.
Lehtonen L., Eerola E., Oksman P., Toivanen P. Muramic acid in peripheral blood leukocytes of healthy human subjects. J. Infect. Dis. 1995; 171(4): 1060-4.
Maitza S.K., Schotz M.C., Yoshikawa Т.T., Guze L.B. Defermination of lipid A and endotoxin in serum by mass-spectroscopy. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 1978; 75(8): 3993-7.
Sugimoto C., Miyagawa E., Mitani K., Nakazawa M., Isayama Y. Cellular fatty acid composition of Haemophilus equigenitalis. J. Clin. Microbiol. 1982; 15(5): 791-4.
Bronds J., Olsen J. Chemotaxonomy at a crossroads? Gas chromatographic analysis of a single colony from the bacterium Haemophylus aphrophilus. J. Chromatogr. 1986; 374(1): 119-25.
Dennemont J., Roupas A., Heitz M. Differentiation of Campylobacter jejuni, C.coli, C.lary and C.fetus fatty acid profiles obtained by gas chromatography — mass spectrometry and by their hippurate hydrolysis. Mitt. Geb. Lebensmittelunters. Hyg.1992; 83(2): 142-8.
Brandtzaeg P., Bryn K., Kierulf P., Ovstebo R., Namork E., Aase B. et al. Meningococcal endotoxin in lethal septic shock plasma studied by gas chromatography, mass-spectrometry, ultracentrifugation and electron microscopy. J. Clin. Invest. 1992; 89 (3): 816-7.
Jantzen E., Bryn K. Whole-cell and lipopolysaccharide fatty acids and sugars of gram-negative bacteria. In: Goodfellow M., Minnikin D., eds. Chemical Methods in Bacterial Systematics. London: Academic Press; 1985: 145-72.
Luderitz O., Galanos C., Lechman V., Mayer H., Rietchel E.T., Weckesser J. Chemical structure and biological activities of lipid A from various bacterial families. Naturwissenschaften. 1978; 65(11): 578-85.
Marmet D., Bornstein N., Flourette J. Identification des Legionella par analyse des acides gras en chromatographie phase gazeose (CPG) et des ubiquinones en chromatographie liquide haute perfomance (CLHP). A nn. Biol. Clin. (Paris). 1988; 46(6): 371-4.
Nurminen M. Chemical characterization of Chlamidia trachomatis LPS. Infect. Immun.1985; 48(2): 573-5.