ИСПОЛЬЗОВАНИЕ ТЕХНОЛОГИИ MELT-MAMA ПЦР ДЛЯ ДИФФЕРЕНЦИАЦИИ ПОДВИДОВ ТУЛЯРЕМИЙНОГО И ЧУМНОГО МИКРОБОВ, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ НА ТЕРРИТОРИИ ГОРНОГО АЛТАЯ
Doi: 10.51620/0869-2084-2023-68-8-496-505 ISSN: 0869-2084 (Print) ISSN: 2412-1320 (Online)
Аннотация
На территории горного Алтая существуют уникальные природные очаги чумы и туляремии. Их уникальность заключается в том, что возбудители этих инфекций — Yersinia pestis и Francisella tularensis, соответственно, представлены каждый двумя подвидами, которые отличаются по своему эпидемиологическому потенциалу. Y. pestis subsp. pestis способна вызвать чуму у людей, в то время как Y. pestis subsp. microtus bv. altaica вызывает инфекцию только у грызунов. F. tularensis subsp. mediasiatica более вирулентен для лабораторных животных, чем subsp. holarctica, но до сих пор не вызвал ни одного подтверждённого случая туляремии у людей. Соответственно, при выделении нового штамма Y. pestis и F. tularensis важной задачей является быстрое и точное определение его подвидовой принадледности. Для этой цели разработаны наборы олигнуклеотидов, предназначенные для детекции диагностически важных SNP методом MELT-MAMA (mismatch amplification mutation assay), позволяющие проводить быструю дифференциацию F. tularensis subsp. mediasiatica от subsp. holarctica и Y. pestis subsp. pestis от Y. pestis subsp. microtus bv. altaica. Описан разработанный метод.
Annotation
On the territory of the Altai Mountains there are unique natural foci of plague and tularemia. Their uniqueness lies in the fact that the causative agents of these infections — Yersinia pestis and Francisella tularensis, respectively, are each represented by two subspecies, which differ in their epidemiological potential. Y. pestis subsp. pestis can cause plague in humans, while Y. pestis subsp. microtus bv. altaica causes infection only in rodents. F. tularensis subsp. mediasiatica is more virulent for laboratory animals than subsp. holarctica, but so far has not caused any confirmed cases of tularemia in humans. Accordingly, when isolating a new strain of Y. pestis and F. tularensis, it is an important task to quickly and accurately determine its subspecific significance. For this purpose, we have developed sets of oligonucleotides designed for the detection of diagnostically important SNPs by the MELT-MAMA method (mismatch amplification mutation assay), which allow for rapid differentiation of F. tularensis subsp. mediasiatica from subsp. holarctica and Y. pestis subsp. pestis from Y. pestis subsp. microtus bv. altaica. Describe the method we have developed.
Для цитирования:
Бахтеева И.В., Евсеева В.В., Титарева Г.М., Рождественский Е.Н., Базарова Г.Х., Мокриевич А.Н., Тимофеев В.С. Использование технологии MELT-MAMA ПЦР для дифференциации подвидов туляремийного и чумного микробов, циркулирующих на территории горного Алтая. Клиническая лабораторная диагностика. 2023; 68 (8): 496-505. DOI: https://doi.org/10.51620/0869-2084-2023-68-8-496-505.
For citation:
Bakhteeva I.V., Evseeva V.V., Titareva G.M., Rozhdestvensky E.N., Bazarova G.H., Mokrievich A.N., Timofeev V.S. The use of MELT-MAMA PCR technology to differentiate the subspecies of tularemia and plague microbes circulating in the territory of the Altai Mountains. Klinicheskaya Laboratornaya Diagnostika (Russian Clinical Laboratory Diagnostics). 2023; 68 (8): 496-505 (in Russ.) DOI: https://doi.org/10.51620/0869-2084-2023-68-8-496-505.