Аннотация
На основе созданной нами базы данных «Белковые профили масс-спектров представителей вида Vibrio cholerae для программы MALDI Biotyper» проведено типирование штаммов холерных вибрионов, выделенных на территории Российской Федерации в 2010-2012 гг., а также проведен анализ степени сходств и отличий константных рибосамальных белков. По результатам MALDI-TOF масс-спектрометрии изучаемые штаммы V. cholerae были разделены на 2 четких кластера. В один кластер вошли все эпидемически опасные штаммы, выделенные от людей, приехавших в Москву из Индии в 2010-2012 гг., во второй — атоксигенные вибрионы, не относящиеся к серогруппам O1/O139, выделенные в 2011 г. у жителей г. Таганрога. Анализ основных спектров всей коллекции позволил нам идентифицировать таксон — специфические компоненты, отличающие штаммы V. cholerae не O1/ не O139 от штаммов V. cholerae El Tor. Таким обрезом, созданная нами база данных протеомных портретов V. cholerae позволяет проводить идентификацию, изучение и типирование возбудителей холеры и других представителей вида V. cholerae, определяя их филогенетическое родство, что чрезвычайно полезно для установления происхождения штаммов, выделенных из объектов окружающей среды, и эпидемиологической расшифровки вспышек заболевания.
Об авторах
Телесманич Наталья РобертовнаФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора; Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека 344002, г. Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40 науч. сотр. plague@aaanet.ru
Список литературы
Кубанова А.А., Говорун В.М., Ильина Е.Н., Верещагин В.А., Фриго Н.В., Припутневич Т.В. Первый опыт применения метода прямого белкового профилирования для идентификации и типирования N. gonorrhoeae. Вестник дерматологии и венерологии. 2006; (5): 25-9.
Маянский Н.А., Калакуцкая А.Н., Мотузова О.В., Ломинадзе Г.Г., Крыясановская О.А., Катосова Л.К. MALDI-TOF масс-спектрометрия в рутинной работе микробиологической лаборатории. Вопросы диагностики в педиатрии. 2011; 3 (5): 20-5.
Chen J.H., Ho P.L., Kwan G.S., She K.K., Siu G.K., Cheng V.C. et al. Direct bacterial identification in positive blood cultures by use of two commercial matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry systems. J. Clin. Microbiol. 2013; 51 (6): 1733-9.
Van Belkum A., Durand G., Peyret M., Chatellier S., Zambardi G., Schrenzel J. et al. Rapid clinical bacteriology and its future impact. Ann. Lab. Med. 2013; 33 (1): 14-27.
Benagli C., Demarta A., Caminada A., Ziegler D., Petrini O., Tonolla M. A rapid MALDI-TOF MS identification database at genospecies level for clinical and environmental Aeromonas strains. PLoS One. 2012; 7 (10). Available at: https://www.plosone.Org/article/info:doi/10.1371/ioumal.pone.0048441.
Wang J., Zhou N., Xu В., Hao H., Kang L., Zheng Y. et al. Identification and cluster analysis of Streptococcus pyogenes by MALDI-TOF mass spectrometry. PLoS One. 2012; 7 (11). Available at: https://www.plosone.Org/article/info:doi/10.1371/ioumal.pone.0047152.