МАСС-СПЕКТРОМЕТРИЧЕСКИЙ МАРКЁР ВИРУЛЕНТНОСТИ VIBRIO CHOLERAE
ISSN: 0869-2084 (Print) ISSN: 2412-1320 (Online)
Аннотация
Цель исследования — выявление масс-спектрометрических протеомных маркёров токсигенности V. cholerae для разработки экспресс-диагностики возбудителя в формате MALDI-ToF. Компьютерному анализу подвергали масс-спектрометрические электронные паспорта 140 штаммов V. cholerae c заведомо известной характеристикой штаммов, которые были разделены на две основные группы по параметру наличия или отсутствия гена холерного токсина (ctx- и ctx+). Впервые выявлен таксон — специфический маркёрный белковый пик, имеющий мол. массу 3202 Da, характерный для штаммов V.cholerae ctx+ и нехарактерный для V.cholerae ctx-.
Об авторах
ФГБОУ ВО «Ростовский государственный медицинский университет» Минздрава РФ 344022, Ростов-на-Дону, Россия аспирант кафедры общей и клинической биохимии № 1 sofik1988@yandex.ru
Список литературы
Кульшань Т.А., Заднова С.П., Челдышова Н.Б., Смирнова Н.И. Оценка функциональных особенностей и стрессоустойчивости изогенных токсигенных и нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae биовара Эль Тор. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии.2015; (3):11-7.
Бочарова Ю.А., Чеботарь И.В., Маянский Н.А. Возможности, проблемы и перспективы масс-спектрометрических технологий в медицинской микробиологии (обзор литературы). Клиническая лабораторная диагностика. 2016; 61(4): 249-56
Zou Q., Yan X., Li B., Zeng X., Zhou J., Zhang J. Proteome analysis of sorbitol fermentation specific protein in Vibrio cholerae by 2-DE and MS. Proteomics. 2006; Mar;6(6):1848-55.
Yan X., Xiao D., Zhao F., Gu Y., Meng F., Zhang J. Analysis of exoproteins of El Tor Vibrio cholerae by 2DE and MALDI-TOF-MS/MS. Acta microbiologica Sinica. 2009; Jun;49(6):746-58.
Ruibai Wang, Hongzhi Zhang, Haiyan Qiu, Shouyi Gao, Biao Kan. Proteins involved in difference of sorbitol fermentation rates of the toxigenic and nontoxigenic Vibrio cholerae El Tor strains revealed by comparative proteome analysis. BMC Microbiology. 2009; 9: 135-44.
Афанасьев М.В., Миронова Л.В., Басов Е.А., Остяк А.С., и др. MALDI-TOF масс-спектрометрический анализ в ускоренной идентификации микроорганизмов рода Vibrio. Молекулярная генетика, микробиология, вирусология. 2014; (3): 22-9.
Детушев К.В., Хомяков А.Е, Тюрин Е.А. Применение MALDI-TOF масс-спектрометрии на приборе Microflex (Bruker Daltonik) для идентификации белковых спектров ПБА I-II групп. Молекулярная диагностика. 2014; 1: 444.
Телесманич Н.Р., Чайка С.О., Чайка И.А., Гончаренко Е.В., Ломов Ю.М. Масс-спектрометрический анализ MALDI-TOF в идентификации и типировании штаммов холерных вибрионов. Клиническая лабораторная диагностика. 2016; 61 (6): 375-9.
Миронова Л.В., Басов Е.А., Афанасьев М.В. и др. MALDI-TOF масс-спектрометрический анализ c молекулярно-генетической идентификацией Vibrio spp. в системе мониторинга вибриофлоры поверхностных водоемов. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2014; 19 (6): 27-36.
Dieckmann R., Strauch E., Alter T. Rapid identification and characterization ofVibriospecies using whole-cell MALDI-TOF mass spectrometry. Journal of applied microbiology. 2010; Jul;109(1):199-211.
Kaveh Emami, Vahid Askari, Matthias Ullrich, Khwajah Mohinudeen, Arga Chandrashekar Anil, Lidita Khandeparker, J. Grant Burgess, Ehsan Mesbahi. Characterization of bacteria in ballast water using MALDI-TOF mass spectrometry. PLoS ONE. 2012; 7(6): e38515.
Гапон М.Н., Телесманич Н.Р., Терновская Л.Н., Чайка С.О., Чайка И.А., Микашинович З.И., Твердохлебова Т.И. Времяпролетная масс-спектрометрическая внутривидовая диагностика штаммов эшерихий, выделенных от человека. Клиническая лабораторная диагностика. 2016; 61 (6): 371-4.
Гапон М.Н., Телесманич Н.Р., Терновская Л.Н., Чайка С.О., Чайка И.А. , Микашинович З.И. Протеомный масс-спектрометрический анализ свежевыделенных штаммов патогенных эшерихий. Журнал микробиологии эпидемиологии и иммунологии. 2015; 3: 83-8.
Телесманич Н.Р., Гончаренко Е.В., Чайка С.О., Чайка И.А., Теличева В.О. Возможности применения MALDI-TOF масс-спекрометрии для изучения углевод — специфических рецепторов диагностического бактериофага эльтор. Журнал микробиологии эпидемиологии и иммунобиологии. 2016; (2): 85-90.
Телесманич Н.Р., Чайка С.О., Чайка И.А. Расширение возможностей линейной MALDI масс-спектрометрии для анализа протеома микроорганизмов на основе создания референс — библиотеки виртуальных профилей. Актуальные вопросы современной медицины. Сборник научных трудов по итогам международной научно-практической конференции. Екатеринбург. Инновационный центр развития образования и науки. 2015; 2: 34-7.
Зуева Е.В., Стоянова Н.А., Токаревич Н.К. Применение метода MALDI-TOF масс-спектрометрии для контроля коллекции штаммов Leptospira, используемых в серодиагностике лептоспироза. Молекулярная диагностика. 2014; 1: 510-1.
Осипов Г.А., Родионов Г.Г. Применение метода масс-спектрометрии микробных маркеров в клинической практике. Лабораторная диагностика. 2013; (2): 68-73.
Paauw A., Trip H., Niemcewicz M., Sellek R., Heng J.M., Mars-Groenendijk R.H. et al. OmpU as a biomarker for rapid discrimination between toxigenic and epidemic Vibrio cholerae O1/O139 and nonepidemic Vibrio cholerae in a modified MALDI-TOF MS assay. BMC Microbiol. 2014; 14: 158
Афанасьев М.В., Миронова Л.В., Басов Е.А., Остяк А.С., Вдовиченко Г.В., Климов В.Т., Богумильчик Е.А., Балахнов С.В. Масс-спектрометрический анализ межвидовой и внутривидовой дифференциации микроорганизмов Yersinia spp. И Vibrio spp. Молекулярная диагностика. 2014; (1): 477-8.
Ульшина Д.В., Ковалев Д.А., Головнева С.И., Чеботарева Е.В. Применение MALDI-TOF масс-спектрометрии для идентификации Brucella spp. Дальневосточный журнал инфекционной патологии. 2014; (25): 111-3.
Водяницкая С.Ю., Телесманич Н.Р., Чайка С.О. Чайка И.А., Иванова Н.Г. MALDI-TOF протеомный анализ в исследовании судовых балластных вод в портах Ростовской области. Жизнь без опасностей. Здоровье. Профилактика. Долголетие. 2014; 4 (9) : 82-9.