Аннотация
Диагностика инфекции кровотока (ИК) актуальна для амбулаторных пациентов. Для получения положительной гемокультуры необходим большой объём крови (CLSI): 2 сета, 40 мл крови для диагностики 95% бактериемий. Молекулярно-генетический метод не может заменить культуральный, хотя ускоряет идентификацию патогена. Культуромика — методология, состоящая из разных условий для выделения микробов из пробы и их молекулярно-генетической идентификации. Использован запатентованный метод прямого посева лейкоцитарного слоя из 4,5 мл пробы венозной крови и метод идентификации MALDI-ToF MS. Из 382 обследованных амбулаторных пациентов гемокультура получена от 183 (48,0%), чаще у женщин (65,6%), у молодых людей (74,9%). Возбудители внебольничной ИК относятся к аэробам (73,4%), анаэробам (24,2%), грибам (2,4%). Преобладают грамположительные кокки (51,4%), редко выделяются грамотрицательные палочки (9,6%). ИК — моноинфекция в 66,5% и смешанная в 33,5%. Ассоциации состоят из 2, 3, 4 патогенов в одной пробе крови (75,4%, 18,8%, 5,8%, соответственно), ассоциация разных видов аэробов составляет 47,8%, ассоциация аэробов и анаэробов — 42,0%. ИК вызывает осложнения основного заболевания органов дыхания, мочеполовой системы, в 100% случаев развивается после пластической хирургии. Для посева лейкоцитарного слоя требуется малый объём крови, прямой посев на агар сокращает срок выдачи ответа до 2-х дней, позволяет проводить генетическую идентификацию патогена на 2-й день от момента взятия крови.
Список литературы
Opota O., Croxatto A., Prod’hom G., Greub G. Blood culture-based diagnosis of bacteraemia: state of the art. Clin. Microbiol. Infect. 2015; 21: 313-22.
Deen J., von Seidlein L., Andersen F., Elle N., White N., Lubell Y. Community-acquired bacterial bloodstream infections in developing countries in south and southeast Asia: a systematic review. Lancet Infect. Dis. 2012; 12(6): 480-7.
Laupland K.B., Kibsey P.C., Gregson D.B., Galbraith J.C. Population-based laboratory assessment of the burden of community-onset bloodstream infection in Victoria, Canada. Epidemiol. Infect. 2013; 141: 174-80.
Kanoksil M., Jatapai A., Peacock S.J. Epidemiology, Microbiology and Mortality Associated with Community-Acquired Bacteremia in Northeast Thailand: A Multicenter Surveillance Study. Plos One. 2013; 8 (1): e54714.
Laupland K.B., Church D.L. Population-Based Epidemiology and Microbiology of Community-Onset Bloodstream Infections. Clin. Microbiol. Rev. 2014; 27(4): 647-64.
Laupland K.B., Gregson D.B., Flemons W.W., Hawkins D., Ross T., Church D.L. Burden of community-onset bloodstream infection: a population-based assessment. Epidemiol. Infect. 2007; 135(6): 1037-42.
Kirn T.J., Weinstein M.P. Update on blood cultures: how to obtain, process, report, and interpret. Clin. Microbiol. Infect. 2013; 19: 513-20.
Wilson M.L., Weinstein M.P. General principles in the laboratory detection of bacteremia and fungemia. Clinics in Laboratory Medicine. 1994; 14(1): 69-82.
Mermel L.A., Maki D.G. Detection of bacteremia in adults: consequences of culturing an inadequate volume of blood. Ann. Intern. Med. 1993; 119: 270-2.
Lin H-H., Liu Y-F., Tien N., Ho C-M., Hsu L-N., Lu J-J. Evaluation of the blood volume effect on the diagnosis of bacteremia in automated blood culturesystems. J. Microb. Immunol. Infect. 2013; 46: 48-52.
Cockerill F.R. III, Wilson J.W., Vetter E.A., Goodman K.M., Torgerson C.A., Harmsen W.S. et al. Optimal testing parameters for blood cultures. Clin. Infect. Dis. 2004; 38(15): 1724-30.
Lee A., Mirrett S., Reller L.B., Weinstein M.P. Detection of bloodstream infections in adults: how many blood cultures are needed? J. Clin. Microbiol. 2007; 45(11): 3546-8.
Patel R., Vetter E.A., Harmsen W.S., Schleck C.D., Fadel H.J., Cockerill F.R. III. Optimized pathogen detection with 30- compared to 20-milliliter blood culture draws. J. Clin. Microbiol. 2011; 49(12): 4047-51.
Ombelet S., Barbe B., Affolabi D., Ronat J-B., Lompo P., Lunguya O. et al. Best practices of blood cultures in low-and middle-income countries. Front. Med. 2019; 6, article 131: 1-27.
Yagupsky P., Nolte F.S. Quantitative aspects of septicemia. Clin. Microbiol. Rev. 1990; 3(3): 269-79.
Washington J.A. Blood cultures: principles and techniques.2nd Mayo Clin. Proc. 1975; 50(2): 91-8.
Weinstein M.P., Reller L.B., Murphy J.R., Lichtenstein K.A. The clinical significance of positive blood cultures: a comprehensive analysis of 500 episodes of bacteremia and fungemia in adults. I. Laboratory and epidemiologic observations. Rev. Infect. Dis. 1983; 5: 35-53.
CLSI. Principles and procedures for blood cultures; approved guideline. In CLSI document M47-A; Clinical and Laboratory Standards Institute: Wayne, PA, USA. 2007; 27(17): 51.
Ilstrup D.M., Waschington J.A. The importance of volume of blood cultured in the detection of bacteremia and fungemia. Diagnostic Microb. and Infect. Dis. 1983; 1(2): 107-10.
Baron E.J., Miller J.M., Weinstein M.P., Richter S.S., Gilligan P.H., Jr T.R.B. et al. A Guide to utilization of the microbiology laboratory for diagnosis of infectious diseases: 2013 Recommendations by the Infectious Diseases Society of America (IDSA) and the American Society for Microbiology (ASM). Clin. Infect. Dis. 2013; 57(4): e22-121.
Tissari P., Zumla A., Tarkka E., Mero S., Savolainen L., Vaara M. et al. Accurate and rapid identification of bacterial species from positive blood cultures with a DNA-based microarray platform: an observational study. Lancet. 2010; 375: 224-30.
Peker N., Couto N., Sinha B., Rossen J.W. Diagnostic of bloodstream infections from positive blood cultures and directly from blood samples: recent developments in molecular approaches. Clin. Microbiol. Infect. 2018; 14: 944-55.
Opota O., Jaton K, Greub G. Microbial diagnosis of bloodstream infection: towards molecular diagnosis directly from blood. Eur. Soc. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2015; 21: 323-31.
Vernon S.D., Shukla S.K., Conradt J., Unger E.R., Reeves W.C. Analysis of 16S rRNA gene sequences and circulating cell-free DNA from plasma of chronic fatigue syndrome and non-fatigued subjects. BMC Microbiol, 2002; 2: 39.
Lagier J-C., Khelaifia S., Alou M.T., Ndongo S., Dione N., Hugon P. et al. Culture of previously uncultured members of the human gut microbiota by culturomics. Nature Microbiology. 2016; 1: 1-8.
Борисова О.Ю., Алёшкин В.А., Каргальцева Н.М., Кочеровец В.И., Пастушенков В.Л., Карпова Е.И. и др. Первый случай выделения в России Rothia mucilaginosa из крови пациентки с осложнением после контурной пластики. Медицинский альманах. 2015; 5(40): 93-6.
Каргальцева Н.М. Способ диагностики бактериемий. Патент РФ № 2098486; 1997.
Humphrey A.A. Use of the buffy layer in the rapid diagnosis of septicemia. Am. J. Clin. Pathol. 1944; 14: 358-62
Самарцев В.А., Еньчева Ю.А., Кузнецова М.В., Карпунина Т.И. Особенности инфицирования ожоговых ран. Новости хирургии. 2014; 22(2): 199-206.
Грувер К.П., Жуховицкий В.Г., Белобородов В.Б. Клинико-эпидемиологические особенности бактериемии. Инфекционные болезни. 2010; 8(4): 13-8.
Чеботкевич В.Н., Бессмельцев С.С., Киселева Е.Е., Стижак Н.П., Кайтанджан Е.И., Бурылев В.В. Клинико-микробиологическая характеристика инфекций кровотока у онкогематологических больных. Онкогематология. 2016; 11(3): 58-67.
Татульян А.А., Кондратьева Е.И., Клещенко Е.И., Трембач А.В. Анализ выявленных бактериемий у пациентов с онкогематологической патологией в многопрофильном детском стационаре Краснодара. Международный научно-исследовательский журнал. 2016; 3(45): 68-73.
Честнова Т.В. Серегина Н.В., Дешко И.В. Сравнительный анализ микробного пейзажа возбудителей, выделенных из крови лихорадящих больных. Вестник новых медицинских технологий. 2012; 19(2): 63-5.
Багирова Н.С. Таксономическая структура и резистентность к антибиотикам возбудителей инфекций кровотока у онкогематологических больных. Клиническая онкогематология. 2015; 8(2): 191-200.
Арефьева Л.И., Горская Е.М., Савостьянова О.А., Спирина Т.С., Ромашкина Л.Ю., Габриэлян И.И. Послеоперационные бактериемии у пациентов кардиохирургического профиля. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2015; 20(5): 19-23.
Гусаров В.Г., Карпов О.Э., Дементиенко М.В., Нестерова Е.Е., Лашенкова Н.Н., Замятин М.Н. Изменение этиологической структуры и клинических исходов бактериемий у хирургических больных как результат мониторинга и управления антибиотикорезистентностью в многопрофильном стационаре. Медицинский вестник Юга России. 2017; 8(1): 51-9.
Учение об инфекции. Воробьёв А.А., ред. М.: Русский врач; 2000.