Применение масс-спектрометрического метода Maldi-Tof для межвидовой дифференциации близкородственных вибрионов

Аннотация

Цель работы — использование масс-спектрометрического анализа для межвидовой дифференциации коллекционных штаммов представителей рода Vibrio и идентификация холерных вибрионов, выделенных из проб судовых балластных вод. Исследовали 207 музейных штаммов культур и 347 микроорганизмов из проб судовых балластных вод. Идентификацию микроорганизмов проводили с использованием MALDI-TOF-масс-спектрометрии. Использование MALDI-биотипирования позволило выявить неточности в видовых и родовых характеристиках коллекционных штаммов V. alginolyticus, V. parahaemolyticus, Shewanella, V. mimicus, усовершенствовать характеристику и качество коллекций микроорганизмов. Показано эффективное применение MALDI для мониторинга судовых балластных вод, что позволяет выявить полный вибриопейзаж патогенных и непатогенных видов. Показана возможность выявления штаммов холерных вибрионов и возбудителей холеры, ориентируясь на V. albensis на этапе отбора подозрительных колоний.

Об авторах

Список литературы

Кубанова А.А., Говорун В.М., Ильина Е.Н., Верещагин В.А., Фриго Н.В., Припутневич Т.А. Первый опыт применения метода прямого белкового профилирования для идентификации и типирования N. gonorrhoeae. Вестник дерматологии и венерологии. 2006; 5: 25-9.

Emami K., Askari V., Ullrich M., Mohinudeen K., Anil A.C. et al. Characterization of Bacteria in Ballast Water Using MALDI-TOF Mass spectrometry. PLoS One. 2012; 7 (6): e38515.

Водяницкая С.Ю., Лях О.В., Рыжков Ю.В., Ломов Ю.М., Прометной В.И., Кругликов В.Д. Проблемы водного балласта: современные аспекты. Эпидемиология и инфекционные болезни. 2011; 5: 18-22.

Методические указания МУ 4.2.1097-02. «Лабораторная диагностика холеры» (утв. Главным государственным санитарным врачом РФ 15 января 2002 г.). М.; 2002.

Ключевые слова