Аннотация
Профили чувствительности оральных стрептококков к антибактериальным препаратам могут отражать информацию о наличии у макроорганизма множества детерминант резистентности. Целью работы являлось выделение спектра оральных стрептококков из микробиоты ротовой полости пациентов и оценка их чувствительности к широкому перечню антибиотиков. Всего 342 микробных стрептококковых изолята были выделены из образцов слюны и отделяемого зубодесневого кармана и протестированы на антибиотикочувствительность. Видовая идентификация стрептококков проводилась с использованием биохимических тест-систем API. Оценка антибиотикорезистентности выполнялась с помощью Е-тестов. Для выявления носительства генов устойчивости к тетрациклинам и макролидам применялся метод ПЦР в режиме реального времени. В ходе исследования было идентифицировано шесть видов оральных стрептококков: S. oralis, S. salivarius, S. mitis, S. sanguinis, S. anginosus и S. mutans. Все стрептококки были чувствительны к линезолиду и меропенему. Доля пенициллин-резистентных стрептококков в подгруппе S. oralis/mitis/mutans составила 47,8% против 23,5% в подгруппе S. salivarius/sanguinis/anginosus (р=0,020). Выявлялись значимые уровни резистентности к макролидам (эритромицин) — 47,9%, тетрациклинам (тетрациклин) — 44,4% и хинолонам (офлоксацин) — 41%. Множественная лекарственная устойчивость (МЛУ) была выявлена у 31,9% изолятов оральных стрептококков, доминировало сочетание устойчивости к эритромицину, тетрациклину и офлоксацину у 79 изолятов (23,1 %). Наиболее распространенными генотипами устойчивости оральных стрептококков к макролидам и тетрациклину у 127 стрептококковых изолятов, проявляющих сочетанную устойчивость, были ermB-mefE+ и tetM+tetQ- соответственно. Таким образом, в структуре антибиотикорезистентных оральных стрептококков преобладали стрептококки группы S. oralis/mitis/mutans, проявляя в том числе МЛУ. Так, находясь в одном из самых густонаселенных биотопов макроорганизма, оральные стрептококки могут являться посредниками для переноса детерминант резистентности более патогенным и клинически-значимым микроорганизмам, в связи с чем необходим тщательный мониторинг за уровнем их восприимчивости к антимикробным препаратам.
Список литературы
Abranches J., Zeng L., Kajfasz J.K., Palmer S.R., Chakraborty B., Wen Z.T. et al. Biology of Oral Streptococci. Microbiol. Spectr. 2018; 6(5):10.
Wade W.G. The oral microbiome in health and disease. Pharmacol. Res. 2013; 69:137-43.
Giannobile W.V., Wong D.T. Salivary diagnostics: oral health and beyond! J. Dent. Res. 2011; 90:1153-4.
Yoshizawa J.M., Schafer C.A., Schafer J.J., Farrell J.J., Paster B.J., Wong D.T. Salivary biomarkers: toward future clinical and diagnostic utilities. Clin. Microbiol. Rev. 2013; 26:781-91.
Willenborg J., Goethe R. Metabolic traits of pathogenic streptococci. FEBS Lett. 2016; 590:3905-19.
Cornejo O.E., Lefebure T., Bitar P.D., Lang P., Richards V.P., Eilertson K. et al. Evolutionary and population genomics of the cavity causing bacteria Streptococcus mutans. Mol. Biol. Evol. 2013; 30:881-93.
Warburton P.J., Ciric L., Lerner A., Seville L.A., Roberts A.P., Mullany P. TetAB46, a predicted heterodimeric ABC transporter conferring tetracycline resistance in Streptococcus australis isolated from the oral cavity. J. Antimicrob. Chemother. 2013 Jan;68(1):17-22.
Naiman R.A., Barrow J.G. Penicillin-resistant bacteria in the mouths and throats of children receiving continous prophylaxis against reumatic fever. Ann. Intern. Med. 1963; 58:768-72.
Маянский Н.А., Кварчия А.З., Бржозовская Е.А., Пономаренко О.А., Крыжановская О.А., Куличенко Т.В. Видовое разнообразие и чувствительность к антибиотикам оральных стрептококков, выделенных у детей. Российский педиатрический журнал. 2019; 22(3): 153-61
Lunde T.M., Roberts A.P., Al-Haroni M. Determination of copy number and circularization ratio of Tn916-Tn1545 family of conjugative transposons in oral streptococci by droplet digital PCR. J. Oral. Microbiol. 2018; 11(1):1552060.
Murray P.R., Baron E. J., Jorgensen J.J., Pfaller M.A., Yolken R.H. Manual of Clinical Microbiology, 8th ed. ASM Press: Washington, DC. 2003. Updated March, 2014.
CLSI. Quality Control for Commercial Microbial Identification Systems. Approved Guideline. CLSI document M50-A. Wayne, PA: Clinical and Laboratory Standards Institute. 2008.
Romney M. H., April N. A., Janet A. H. Understanding and Addressing CLSI Breakpoint Revisions: a Primer for Clinical Laboratories. Journal of Clinical Microbiology. 2019, 57 (6) e00203-19; DOI: 10.1128/JCM.00203-19.
CLSI M100 ED29:2019 — Performance standards for Antimicrobial susceptibility Testing, 29th еd.
Richter S.S., Howard W.J., Weinstein M.P. Multicenter evaluation of the BD Phoenix automated microbiology system for antimicrobial susceptibility testing of Streptococcus species. J. Clin. MIcrobiol. 2007; 45(9):2863-71.
Chun S., Huh H.J., Lee N.Y. Species-specific difference in antimicrobial susceptibility among viridans group streptococci. Ann. Lab. Med. 2015; 35(2): 205-11.
Nielsen M.J., Claxton S., Pizer B., Lane S., Cooke P., Paulus S. Viridans Group Streptococcal Infections in children after che- motherapy or Stem cell Transplantation: a 10-year review from a Tertiary Pediatric hospital. Medicine (baltimore). 2016; 95(9): e2952.
Брико Н.И., Дмитриева Н.Ф., Клейменов Д.А., Липатов К.В., Глушкова Е.В., Котин В.В. Чувствительность к антибиотикам стрептококков группы А различных emm генотипов, выделенных от больных инвазивными и неинвазивными инфекциями мягких тканей. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2015; 17(1): 67-72
Peter C.A. Resistance among Streptococcus pneumoniae: Implications for Drug Selection. Clinical Infectious Diseases. 2002; 34(12):1613-20.
Tantivitayakul P., Lapirattanakul J., Vichayanrat T., Muadchiengka T. Antibiotic Resistance Patterns and Related Mobile Genetic Elements of Pneumococci and β-Hemolytic Streptococci in Thai Healthy Children. Indian Journal of Microbiology. 2016; 56(4):417-25.
Bhardwaj N., Mathur P., Behera B., Mathur K., Kapil A., Misra M.C. Antimicrobial resistance in beta-haemolytic streptococci in India: A four-year study. Indian J. Med. Res. 2018; 147(1):81-7
Ильясов Ю.Ю., Лыгина Е.С., Дмитриев А.В. Спектр антибиотикорезистентности клинических изолятов стрептококков групп С и G, патогенных для человека. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2013; 15(3):235-8
Kim S.M., Kim H.C., Lee S.W.S. Characterization of antibiotic resistance determinants in oral biofilms. J. Microbiol. 2011;49(4):595-602.
Roberts A.P, Mullany P. Oral biofilms: a reservoir of transferable, bacterial, antimicrobial resistance. Expert Rev. Anti Infect. Ther. 2010;8(12):1441-50.
Roberts A.P., Mullany P. Tn916-like genetic elements: a diverse group of modular mobile elements conferring antibiotic resistance. FEMS Microbiol. Rev. 2011;35(5):856-71.
Seville L.A., Patterson A.J., Scott K.P. Distribution of tetracycline and erythromycin resistance genes among human oral and fecal metagenomic DNA. Microb. Drug Resist. 2009;15(3):159-66
Chang S.C., Chang H.J., Lai M.S. Antibiotic usage in primary care units in Taiwan. Int. J. Antimicrob. Agents. 1999; 11(1):23-30.
Ioannidis I., Sakellari D., Spala A. Prevalence of tetM, tetQ, nim and blaTEM genes in the oral cavities of Greek subjects: a pilot study. J. Clin. Microbiol. 2009;36(7):569-74.
Lancaster H., Bedi R., Wilson M. The maintenance in the oral cavity of children of tetracycline-resistant bacteria and the genes encoding such resistance. J. Antimicrob. Chemother. 2005;56(3):524-31
Frazzon A.P. Gama B.A., Hermes V. Prevalence of antimicrobial resistance and molecular characterization of tetracycline resistance mediated by tet (M) and tet (L) genes in Enterococcus spp. isolated from food in Southern Brazil. World J.Microbiol. Biotechnol. 2010; 26(2):365-70.
Roberts M.C. Update on acquired tetracycline resistance genes. FEMS Microbiol. Lett. 2005;245(2):195-203.
Tong J., Lu X., Zhang J. Occurrence of antibiotic resistance genes and mobile genetic elements in enterococci and genomic DNA during anaerobic digestion of pharmaceutical waste sludge with different pretreatments. Bioresour Technol. 2017; 235:316-24.