Сравнительный анализ методов идентификации Corynebacterium non diphtheria

Аннотация

Проведен сравнительный анализ эффективности трех методов идентификации Corynebacterium non diphtheriae: бактериологического, молекулярно-генетического (секвенирование по 16S рРНК), масс-спектрометрического (MALDI-ToF MS). Исследовано 49 штаммов Corynebacterium non diphtheriae (С. pseudodiphtheriticum, С. amycolatum, C. aurimucosum, C. propinquum, C. falsenii) и 2 штамма Corynebacterium diphtheriae, выделенных при различной патологии из урогенитального тракта и верхних дыхательных путей. Коринебактерии идентифицировали бактериологическим методом, секвенированием по 16S рРНК и масс-спектрометрометрическим методом (MALDI ToF). Полное совпадение результатов видовой идентификации отмечено у 26 (51%) штаммов C. non diphtheriae при использовании трех методов исследования, у 43 (84,3%) — при сравнении бактериологического метода и секвенирования по 16S рРНК, у 29 (57%) — при масс-спектрометрическом исследовании и секвенировании по 16S рРНК. Бактериологический метод эффективен для идентификации C. Diphtheriae. Для точного установления видовой принадлежности коринебактерий с вариабельными биохимическими свойствами необходимо использовать молекулярно-генетический метод исследования. Масс-спектрометрический метод (MALDI-ToFMS) требует дальнейшего пополнения баз данных для определения более широкого спектра представителей рода Corynebacterium.

Об авторах

Список литературы

Харсеева Г.Г., Воронина Н.А., Гасретова Т.Д., Мамычева Н.И., Голованова Н.А. Персистентные свойства Corynebacterium non diphtheriae, циркулирующих в г. Ростове-на-Дону и Ростовской области. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2012; 3: 13-7.

Cazanave С., Greenwood-Quaintance K.E., Hanssen A.D., Patel R. Corynebacterium prosthetic joint infection. J. Clin. Microbiol. 2012; 50 (5): 1518-23.

Coyle M.B., Lipsky В.А. Coryneform bacteria in infectious diseases: clinical and laboratory aspects. Clin. Microbiol. Rev. 1990; 3 (3): 227-46.

Knox K., Nolmes А. Nosocomial endocarditis caused by Corynebacterium amycolatum and other non diphtheriae corynebacterium. Emerg. Infect. Dis. 2002; 8 (1): 97-9.

Reddy B.S., Chaudhury А., Kalawat U., Jayaprada R., Reddy G., Ramana B.V. Isolation, speciation, and antibiogram of clinically relevant non-diphtherial Corynebacteria (Diphtheroids). Indian J. Med. Microbiol. 2012; 30 (1): 52-7.

Ключевые слова