Научно-практический журнал Клиническая лабораторная диагностика

СРАВНИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ ТРЕХ МЕТОДОВ ИДЕНТИФИКАЦИИ ГРИБОВ РОДА CANDIDA, ВЫДЕЛЕННЫХ ПРИ ПНЕВМОНИЯХ (ХРОМОГЕННЫЙ АГАР, БАКАНАЛИЗАТОР VITEK2 COMPACT 30, МАСС-СПЕКТРОМЕТР MICROFLEX)

Doi: 10.51620/0869-2084-2024-69-11-617-626 ISSN: 0869-2084 (Print) ISSN: 2412-1320 (Online)

Купить
Аннотация Об авторах Список литературы Ключ. слова

Аннотация

Цель работы – сравнительный анализ трех методов идентификации грибов рода Candida: с помощью хромогенного агара,
баканализатора Vitek 2 Compact 30, масс-спектрометра MicroFlex.
Материал и методы. Исследовано 106 штаммов дрожжевых грибов, выделенных из респираторных образцов больных пнев-
монией и аутопсийных проб при болезни с летальным исходом в 2022 – 2023 годах.
Результаты. Первоначальная скрининговая идентификация проведена на HiCrome агаре, в результате чего все 106 изолятов
разделены на 4 вида Candida (C. albicans – 54,7%, Nakaseomyces glabrata (C. glabrata) – 16,0%, Pichia kudriavzevii (C. krusei)
– 12,3%, C. tropicalis – 11,3%) и изоляты с сомнительной таксономической принадлежностью (5,7%). Последующая иденти-
фикация с помощью баканализатора Vitek 2 Compact 30 и масс-спектрометра MicroFlex показала сходимость результатов
для C. albicans: 93,7 – 96,6%, дополнительно выявлены с помощью двух уточняющих методов C. dubliniensis и Clavispora
lusitaniae (Candida lusitaniae). Сходимость результатов для N. glabrata (C. glabrata): 41,7 – 41,2%, дополнительно выявлены
виды Kluyveromyces marxianus, P. kudriavzevii (ранее известные как C. kefyr и C. krusei соответственно), C. inconspicua. Для
P. kudriavzevii (C. krusei) сходимость результатов: 55,6 – 69,2%, дополнительно выявлены виды C. tropicalis, K. marxianus (C.
kefyr), C. dubliniensis, C. inconspicua. Для C. tropicalis сходимость результатов равна 100%.
Выводы. Скрининговый метод идентификации грибов рода Candida на хромогенном агаре наиболее надежен для C. albicans
и C. tropicalis. В уточняющей идентификации нуждаются изоляты N. glabrata (C. glabrata) и P. kudriavzevii (C. krusei). До-
полнительное использование баканализатора Vitek 2 Compact 30 и масс-спектрометра MicroFlex позволило в 14,1% случаев
выявить участие грибов Candida non-аlbicans в развитии пневмоний. В 1,9% случаев выявлены грибы, не относящиеся к роду
Candida.

Annotation

The purpose of the work is a comparative analysis of three methods for identifying fungi of the genus Candida: using chromogenic
agar, a Vitek 2 Compact 30 bacterial analyzer, and a MicroFlex mass spectrometer.
Material and methods. We studied 106 strains of yeast fungi isolated from respiratory samples of patients with pneumonia and
autopsy samples from a fatal disease in 2022–2023. Results. Initial screening identification was carried out on HiCrome agar, as a
result of which all 106 isolates were divided into 4 Candida species (C. albicans — 54.7%, Nakaseomyces glabrata (C. glabrata) —
16.0%, Pichia kudriavzevii (C. krusei) — 12.3%, C. tropicalis – 11.3%) and isolates with questionable taxonomic affiliation (5.7%).
Subsequent identification using Vitek 2 Compact 30 bacterial analyzer and MicroFlex mass spectrometer showed the convergence
of results for C. albicans: 93.7 – 96.6%; C. dubliniensis and Clavispora lusitaniae (Candida lusitaniae) were additionally identified
using two clarifying methods. Convergence of results for N. glabrata (C. glabrata): 41.7 – 41.2%, additionally identified species
were Kluyveromyces marxianus, P. kudriavzevii (previously known as C. kefyr and C. krusei, respectively), C. inconspicua. For P.
kudriavzevii (C. krusei), the convergence of results: 55.6 – 69.2%, additionally identified species were C. tropicalis, K. marxianus (C.
kefyr), C. dubliniensis, C. inconspicua. For C. tropicalis, the convergence of results is 100%.
Conclusions. The screening method for identifying fungi of the genus Candida on chromogenic agar is most reliable for C. albicans
and C. tropicalis. Isolates of N. glabrata (C. glabrata) and P. kudriavzevii (C. krusei) require further identification. The additional use
of Vitek 2 Compact 30 bacterial analyzer and MicroFlex mass spectrometer made it possible to identify the involvement of Candida
non-albicans fungi in the development of pneumonia in 14.1% of cases. In 1.9% of cases, fungi not belonging to the genus Candida
were detected.
Key words: yeast fungi; identification; chromogenic agar; bacterial analyzer Vitek 2; MALDI- TОF mass spectrometry

Для цитирования:

Огиенко О.Н., Бондаренко А.П., Катаева Л.В., Степанова Т.Ф., Голубева А.О., Троценко О.Е. Сравни-
тельный анализ трех методов идентификации грибов рода Candida, выделенных при пневмониях (хромогенный агар, бака-
нализатор Vitek2 Compact 30, масс-спектрометр MicroFlex). Клиническая лабораторная диагностика. 2024; 69 (11): 617-626.
DOI: https://doi.org/10.51620/0869-2084-2024-69-11-617-626

For citation:

Ogienko O.N., Bondarenko A.P., Kataeva L.V., Stepanova T.F., Golubeva A.O., Trotsenko O.E. Comparative analysis
of three methods for identifying Candida yeast isolated from pneumonia (chromogenic agar, Vitek2 Compact 30 bacterial analyzer,
Microflex mass spectrometer). Klinicheskaya Laboratornaya Diagnostika (Russian Clinical Laboratory Diagnostics). 2024; 69 (11):
617-626 (in Russ.).
DOI: https://doi.org/10.51620/0869-2084-2024-69-11-617-626