Аннотация
В статье представлены результаты многолетнего мониторинга (2014-2018 гг.) чувствительности к антибиотикам штаммов Salmonella, выделенных от детей и взрослых с диарейным синдромом в Санкт-Петербурге. 746 изученных штаммов относились к 42 сероварам, из них более 90,0% принадлежали к трем: S.enteritidis (79,6%), S.typhimurium (6,8%) и S.infantis (3,8%). Определение чувствительности к 7 классам антибиотиков, проведенное согласно рекомендациям EUCAST, выявило устойчивость у 78,6% штаммов. Резистентность к хинолонам, обнаруженная у 63,3% штаммов (S.enteritidis -71,0%, S.typhimurium — 15,7%, S.infantis — 89,3%), у всех штаммов, за исключением одного, характеризовалась низким уровнем (МПК ципрофлоксацина 0,12-0,5 мг/л) и была обусловлена пятью видами однонуклеотидных замен в гене gyrA: Asp87Tyr — 36,1% штаммов (S.infantis); Ser83Phe — 22,2% (S.enteritidis); Asp87Asn — 19,4% (S.enteritidis, S.typhimurium, S.hadar, S.newport); Ser83Tyr -11,1% (S.enteritidis, S.infantis) и Asp87Gly — 8,3% (S.enteritidis). У одного штамма S.kentucky с устойчивостью высокого уровня (МПК ципрофлоксацина выше 8,0 мг/л) выявлены одновременно две замены Ser83Phe и Asp87Asn. Два штамма (S.typhimurium и S.corvallis) имели плазмидоопосредованную резистентность к хинолонам (ген qnrS). Устойчивость к цефалоспоринам расширенного спектра обнаружена у штаммов шести сероваров (1,6%). Выявлены гены бета-лактамаз расширенного спектра генетических групп СТХ-М1 (10 штаммов сероваров S.typhimurium, S.enteritidis, S.abony, S.coeln и S.virchow), СТХ-М2 (2 штамма S.typhimurium), СТХ-М9 (три штамма S.enteritidis), у одного штамма S.typhimurium выявлены одновременно СТХ-М1 и СТХ-М2. У двух штаммов (S.newport и S.enteritidis) обнаружены гены цефалоспориназы молекулярного класса С CMY-2. Наше исследование показало, что в Санкт-Петербурге штаммы Salmonella, ведущего возбудителя острых кишечных инфекций бактериальной этиологии у детей и взрослых, характеризуются устойчивостью к антибиотикам, используемым для лечения сальмонеллезов.
Список литературы
О состоянии санитарно-эпидемиологического благополучия населения в Российской Федерации в 2018 году: Государственный доклад. М.:Федеральная служба по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека; 2019. 254 с. Available at: https://rospotrebnadzor.ru/upload/iblock/798/gosudarstvennyy-doklad-o-sostoyanii-sanitarno_epidemiologicheskogo-blagopoluchiya-naseleniya-v-rossiyskoy-federatsii-v-2018-godu.pdf
Андреева И.В., Стецюк О.У. Отпуск без проблем: современные подходы к профилактике и лечению диареи путешественников. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2018; 20(3):172-80.
Клинические рекомендации (протокол лечения) оказания медицинской помощи детям, больным сальмонеллезом. ФГБУ НИИДИ ФМБА России. Утв. 09.10.2013. Available at: https://niidi.ru/dotAsset/6501246b-27f5-4d17-964d-7dc4defb8b43.pdf
Crump J.A., Sjölund-Karlsson M., Gordon M.A., Parry C.M. Epidemiology, clinical presentation, laboratory diagnosis, antimicrobial resistance, and antimicrobial management of invasive Salmonella infections. Clin. Microbiol. Rev. 2015; 28 (4): 901-37.
Guarino A., Ashkenazi S., Gendrel D., Vecchio A.L., Shamir R., Szajewskaеt H. European Society for Pediatric Gastroenterology, Hepatology, and Nutrition/European Society for Pediatric Infectious Diseases evidence-based guidelines for the management of acute gastroenteritis in children in Europe: update 2014. J. Pediatr. Gastroent. Nutr. 2014;59(1):132-52.
Riddle M.S., DuPont H.L., Bradley A., Connor B.A. ACG Clinical Guideline: Diagnosis, Treatment, and Prevention of Acute Diarrheal Infections in Adults. Am. J. Gastroenterol. 2016; 111: 602-22.
EFSA and ECDC, 2019. The European Union summary report on antimicrobial resistance in zoonotic and indicator bacteria from humans, animals and food in 2017. EFSA Journal. 2019;17 (2):5598, 278 pp. Available at: https://doi.org/10.2903/j.efsa.2019.5598
Методические указания «Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам». МУК 4.2.1890-04. Утверждено Главным государственным санитарным врачом РФ 04.03.2004. Available at: https://docs.cntd.ru/document/1200038583
Клинические рекомендации «Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам». Available at: https://www.antibiotic.ru/minzdrav/files/docs/clrec-dsma2015.pdf
Ахметова Л.И., Розанова С.М. Чувствительность к антимикробным препаратам штаммов шигелл и сальмонелл, выделенных в Екатеринбурге. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2000; 2(3): 58-62.
Милютина Л.Н., Гурьева О.В. Эволюция лекарственной резистентности сальмонелл, выделенных от детей, и ее клиническая значимость. Лаборатория. 2011; 3: 5-7.
Шитова О.И., Казьянин А.В., Захарова Ю.А. Эпидемиологические особенности, биологическая характеристика и чувствительность к антимикробным препаратам сальмонелл, циркулирующих в Пермском крае. Сибирский медицинский журнал. 2011; 26(2):116-20.
Kozyreva V.K., Ilina E.N., Malakhova M.V., Carattoli A., Azizov I.S., Tapalski D.V, et al. Long-term dissemination of CTX-M-5-producing hypermutable Salmonella enterica serovar typhimurium sequence type 328 strains in Russia, Belarus, and Kazakhstan. Antimicrob. Agents Chemother. 2014; 58(9): 5202-10
Елиусизова А.Б., Шубин Ф.Н., Кузнецова Н.А., Бахолдина С.И. Чувствительность к фторхинолонам сальмонелл в Сибири и на Дальнем Востоке. Тихоокеанский медицинский журнал. 2010; 4: 51-4.
Халиуллина С.В., Анохин В.А., Герасимова Е.С., Леонтьева Н.С., Малышева Л.М., Гутор И.А. Антибиотикорезистентность современных возбудителей внебольничных бактериальных кишечных инфекций у детей. Практическая медицина. 2010; 1(40): 85-8.
Гончар Н.В., Лазарева И.В., Рычкова С.В., Кветная А.С., Альшаник Л.П., Фомичева Ю.В. и др. Заболеваемость детей сальмонеллезом и уровень резистентности клинических штаммов сальмонелл к антибактериальным препаратам в Санкт-Петербурге. Журнал инфектологии. 2015; 7(1): 80-6.
Решетнева И.Т., Перьянова О.В., Дмитриева Г.М., Остапова Т.С. Антибиотикорезистентность сальмонелл, выделенных на территории Красноярского края. Гигиена и санитария. 2015; 94 (2): 35-8.
Евмененкова И.Г., Мурач Л.В. Анализ резистентности штаммов Salmonella spp. к антибиотикам в Смоленском регионе за 2012-2017 гг. Смоленский Медицинский Альманах. 2018; 1: 93-6.
Кузнецова Н.А., Соловьева А.С., Раков А.В. Чувствительность к антибиотикам у штаммов Salmonella Enteritidis, циркулирующих на территории Сибири и Дальнего Востока, поданным многолетнего мониторинга. Здоровье. Медицинская экология. Наука. 2018; 3: 50-8.
European Centre for Disease Prevention and Control. EU protocol for harmonised monitoring of antimicrobial resistance in human Salmonella and Campylobacter isolates — June 2016. Stockholm: ECDC; 2016. Available at: https://ecdc.europa.eu/sites/portal/files/media/en/publications/Publications/antimicrobial-resistance-Salmonella-Campylobacter-harmonised-monitoring.pdf
Egorova S., Kaftyreva L., Grimont P.A.D, Weill F-X. Prevalence and characterization of extended-spectrum cephalosporin resistant non-typhoidal Salmonella isolates in adults in St-Petersburg, Russia (2002-2005). Microbial Drug Resistance. 2007; 13(2):102-7.
The EUCAST guideline on detection of resistance mechanisms v 2.0 (2017-07-11). Available at: https://www.eucast.org/fileadmin/src/media/PDFs/EUCAST_files/Resistance_mechanisms/EUCAST_detection_of_resistance_mechanisms_170711.pdf
Dallenne C., Da Costa A., Decré D., Favier C., Arlet G. Development of a set of multiplex PCR assays for the detection of genes encoding important beta-lactamases in Enterobacteriaceae. J. Antimicrob. Chemother. 2010; 65(3): 490-5.
Weill F.X., Fabre L., Grandry B., Grimont P.A.D., Casin I. Multiple-antibiotic resistance in Salmonella enterica serotype Paratyphi B isolates collected in France between 2000 and 2003 is due mainly to strains harboring Salmonella genomic islands 1, 1-B, and 1-C. Antimicrob. Agents Chemother. 2005; 49(7): 2793-2801.
Robicsek A., Strahilevitz J., Sahm D.F., Jacoby G.A., Hooper D.C. Qnr prevalence in ceftazidime-resistant Enterobacteriacae isolates from the United States. Antimicrob. Agents Chemother. 2006; 50(8): 2872-4.
Cavaco L., Hasman H., Xia S., Aarestrup F. qnrD, a Novel Gene Conferring Transferable Quinolone Resistance in Salmonella enterica Serovar Kentucky and Bovismorbificans Strains of Human Origin. Antimicrob. Agents Chemother. 2009; 53(2):603-8.
Wang M., Guo Q., Xu X., Wang X., Ye X., Wu S., et al. New plasmid-mediated quinolone resistance gene, qnrC, found in a clinical isolate of Proteus mirabilis. Antimicrob. Agents Chemother. 2009; 53(5):1892-7.
Park C.H., Robicsek A., Jacoby G.A., Sahm D., Hooper D.C. Prevalence in the United States of aac(6’)-Ib-cr encoding a ciprofloxacin-modifying enzyme. Antimicrob. Agents Chemother. 2006; 50(11): 3953-5.
Козырева В.К., Эйдельштейн М.В., Топальский Д.В., Азизов И.С., Козлов Р.С. Независимое приобретение резистентности к хинолонам у клонально-родственных нозокомиальных штаммов вследствие гипермутабельности. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия. 2012; 14(2): 153-61.
Рожнова С.Ш., Акулова Н.К., Христюхина О.А. Этиологическая структура сальмонеллезов у детей раннего возраста. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2015; 1(80): 56-8.
CDC. National Antimicrobial Resistance Monitoring System for Enteric Bacteria (NARMS): Human Isolates Surveillance Report for 2015 (Final Report). Atlanta, Georgia: U.S. Department of Health and Human Services, CDC, 2018. Available at https://www.cdc.gov/narms/pdf/2015-NARMS-Annual-Report-cleared_508.pdf
Tadesse G., Tessema T.S., Beyene G., Aseffa A. Molecular epidemiology of fluoroquinolone resistant Salmonella in Africa: A systematic review and meta-analysis. PLoS ONE. 2018; 13(2):e0192575.
McDermott P.F., Tyson G.H., Kabera C., Chen Y., Li C., Folster J.P., et al. Whole-genome sequencing for detecting antimicrobial resistance in nontyphoidal Salmonella. Antimicrob. Agents Chemother. 2016; 60: 5515-20.
EFSA and ECDC (European Food Safety Authority and European Centre for Disease Prevention and Control), 2018. The European Union summary report on trends and sources of zoonoses, zoonotic agents and food-borne outbreaks in 2017. EFSA Journal. 2018;16(12):5500, 262.
WHO publishes list of bacteria for which new antibiotics are urgently needed. News Release 27.02.2017. Available at https://www.who.int/ru/news-room/detail/27-02-2017-who-publishes-list-of-bacteria-for-which-new-antibiotics-are-urgently-needed