Аннотация
Цель. Времяпролетный масс-спектрометрический анализ свежевыделенных от человека популяций кишечной палочки для идентификации маркеров протеома, характерных для гемолитических и негемолитических штаммов, эшерихий — ассоциантов условно патогенных энтеробактерий. Материалы и методы. 20 штаммов монопопуляции гемолитических эшерихий; 100 штаммов монопопуляции негемолитических эшерихий; 15 негемолитических штаммов, выделенных из ассоциации с условно патогенными энтеробактериями. Белковое профилирование на масс-спектрометре MALDI-TOF MS Autoflex «Bruker Daltonik». Результаты. Значение внутри вида масс-заряда пика со 100% интенсивностью, равного 9000 Да, может служить дифференциальным признаком выявления гемолитических эшерихий при масс-спектрометрическом биотипировании. Заключение. Даны протеомные характеристики штаммов разных популяций внутри вида Escherichia coli; установлены таксон-специфические маркеры для протеомной дифференциации популяции эшерихий.
Об авторах
Гапон Марина НиколаевнаФБУН «Ростовский НИИ микробиологии и паразитологии» Роспотребнадзора г. Ростов-на-Дону, 344000, Россия канд. биол. наук, вед. науч. сотр. лаборатории санитарной микробиологии водных объектов и микробной экологии человека ФБУН «Ростов НИИ микробиологии и паразитологии» Роспотребнадзора marina.gapon@mail.ru
Список литературы
Williamson Y.M., Moura H., Woolfitt A.R., Pirkle J.L., Barr J.R., Carvalho Mda G. et al. Differentiation of Streptococcus pneumoniae conjunctivitis outbreak isolates by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. Appl. Environ. Microbiol. 2008; 74 (19): 5891-7.
Кубанова А.А., Говорун В.М., Ильина Е.Н., Верещагин В.А., Фриго Н.В., Припутневич Т.В. Первый опыт применения метода прямого профилирования для идентификации и типирования N. gonorrhoeae. Вестник дерматологии и венерологии. 2006; (5): 25-9.
Телесманич Н.Р., Агафонова В.В., Чемисова О.С., Чайка И.А., Водопьянов О.С., Водопьянов А.С. и др. Протеомный масс-спектрометрический анализ и типирование штаммов Vibrio cholerae, выделенных на территории Российской Федерации в 2010-2012 г.г. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2014; (2): 97-9.
Pribil P., Fenselau C. Characterization of Enterobacteria using MALDI-TOF mass spectrometry. Anal. Chem. 2005; 77 (18): 6092-5.
Гапон М.Н. Показатели местной неспецифической резистентности при дисбактериозе толстой кишки. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2010; (5): 53-7.
Гриценко В.А., Бухарин О.В. Экологические и медицинские аспекты симбиоза Escherichia coli и человека. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2000; (3): 93-9.