ВЫСОКОСПЕЦИФИЧНЫЙ И ЧУВСТВИТЕЛЬНЫЙ АНАЛИЗ РЕПЕРТУАРА СЫВОРОТОЧНЫХ АНТИТЕЛ С ПОМОЩЬЮ ПЕПТИДНЫХ МИКРОЧИПОВ У ПАЦИЕНТОВ С ДИАГНОЗОМ РАК МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ

Аннотация

В настоящее время для ранней диагностики актуален поиск новых биомаркеров рака. В качестве альтернативы существующим биомаркерам большой интерес приобретают антитела (АТ) против антигенов, ассоциированных с опухолями. Изменение количества и специфичности АТ в сыворотке крови указывает на происходящие процессы в организме, в том числе на развитие онкологических заболеваний. В работе приведены результаты анализа репертуара антител (иммуносигнатуры) с помощью пептидных микрочипов у пациентов с диагнозом рака молочной железы (РМЖ). Мы выявили 119 информативных пептидов из 330 034 пептидов, представленных на микрочипе, связывание антител с которыми демонстрирует статистически значимые межгрупповые различия (p < 0,001). Эта панель пептидов помогает с высокой чувствительностью и специфичностью различать сыворотки больных и здоровых доноров. Оценка репертуара антител, взаимодействующих с панелью синтетических пептидов, может быть использована для разработки диагностических тестов при обнаружении РМЖ на ранних стадиях.

Об авторах

Список литературы

GBD 2015 Risk Factors Collaborators. Global, regional, and national comparative risk assessment of 79 behavioural, environmental and occupational, and metabolic risks or clusters of risks, 1990-2015: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2015. Lancet. 2016; 388(10053): 1659-724.

Каприна А.Д., Старинский В.В., Петрова Г.В. Злокачественные новообразования в России в 2015 году (заболеваемость и смертность). МНИОИ им. П.А. Герцена — филиал ФГБУ «НМИРЦ» Минздрава России. 2017; 4-5.

Assi V., Warwick J., Cuzick J., Duffy S.W. Clinical and epidemiological issues in mammographic density. Nature Reviews Clinical Oncology. 2011; 9(1): 33-40.

Ries LAG., Melbert D., Krapcho M. SEER Cancer Statistics Review, 1975-2005; National Cancer Institute [Internet]. Available from: https://seer.cancer.gov/csr/1975_2005/

Семиглазов В.Ф., Семиглазов В.В. Скрининг рака молочной железы. Практическая онкология. 2010; 11(2): 60-5.

Семиглазов В.Ф., Семиглазов В.В. Опухолевые маркеры при раке молочной железы. Врач. 2011; 12: 2-7.

Шаповал А.И., Легутки Д.Б., Стаффорд Ф., Требухов А.В., Джонстон С., Шойхет Я.Н. и др. Иммуносигнатура (immunosignature) — пептидные микроэррей для диагностики рака и других заболеваний. Российский онкологический журнал. 2014; 4: 6-11.

Shi R., Taylor H., McLarty J., Liu L., Mills G., Burton G. Effects of payer status on breast cancer survival: a retrospective study. BMC Cancer. 2015; 15(211): 2-8.

Тамкович С.Н., Войцицкий В.Е., Лактионов П.П., Современные методы диагностики рака молочной железы. Биомедицинская химия. 2014; 60(2): 141-60.

Bardou V.J., Arpino G., Elledge R.M., Osborne C.K., Clark G.M. Progesterone receptor status significantly improves outcome prediction over estrogen receptor status alone for adjuvant endocrine therapy in 2 large breast cancer databases. Journal of Clinical Oncology. 2003; 21: 1973-9.

Cheang M.C., Martin M., Nielsen T.O., Prat A., Voduc D., Rodriguez-Lescure A. et al. Defining breast cancer intrinsic subtypes by quantitative receptor expression. Oncologist. 2015; 20: 474-82.

Chlebowski R.T., Manson J.E., Anderson G.L., Cauley J.A., Aragaki A.K., Stefanick M.L. et al. Estrogen plus progestin and breast cancer incidence and mortality in the Women’s Health Initiative Observational Study. Journal of the National Cancer Institute. 2013; 105: 526-35.

Füzéry A.K., Levin J., Chan M.M., Chan D.W. Translation of proteomic biomarkers into FDA approved cancer diagnostics: issues and challenges. Clinical Proteomics. 2013; 10(1): 13-5.

Sawyers C.L. The cancer biomarker problem. Nature. 2008; 452(7187): 548-52.

Hughes A.K., Cichacz Z., Scheck A., Stephen W.C., Johnston S.A., Stafford P. Immunosignaturing can detect products from molecular markers in brain cancer. PLoS One. 2012; 7(7): 1-7.

Liping D., Ningjing L., Mei L., Zhang J.Y. Autoantibodies to tumor-associated antigens as biomarkers in human hepatocellular carcinoma (HCC). Experimental Hematology & Oncology. 2013; 2(15): 3-7.

Zhang J.Y., Casiano C.A., Peng X.X., Koziol J.A., Chan E.K., Tan E.M. Enhancement of antibody detection in cancer using panel of recombinant tumor-associated antigens. Cancer Epidemiology Biomarkers & Prevention Journal. 2003; 12(2): 136-43.

Sykes K.F., Legutki J.B., Stafford P. Immunosignaturing: a critical review. Trends in Biotechnology. 2013; 31(1): 45-51.

Zaenker P., Ziman M.R. Serologic autoantibodies as diagnostic cancer biomarkers — a review. Cancer Epidemiology Biomarkers & Prevention Journal. 2013; 22(12): 2161-81.

Legutki J.B., Zhao Z.G., Greving M., Woodbury N., Johnston S.A., Stafford P. Scalable high-density peptide arrays for comprehensive health monitoring. Nature Communications. 2014; 5: 4785.

Kukreja M., Johnston S.A., Stafford P. Comparative study of classification algorithms for immunosignaturing data. BMC Bioinformatics. 2012; 13(139): 2-15.

Legutki J.B., Magee D.M., Stafford P., Johnston S.A. A general method for characterization of humoral immunity induced by a vaccine or infection. Vaccine. 2010; 28(28): 4529-37.

Restrepo L., Stafford P., Magee D.M, Johnston S.A. Application of immunosignatures to the assessment of Alzheimer’s disease. Annals of Neurology. 2011; 70(2): 286-95.

Steinhoff C., Vingron M. Normalization and quantification of differential expression in gene expression microarrays. Briefings in Bioinformatics. 2006; 7(2):166-77.

Lacombe J., Mangé A., Solassol J. Use of autoantibodies to detect the onset of breast cancer. Journal of Immunology Research. 2014; 8.

Brown J.R., Stafford P., Johnston S.A., Dinu V. Statistical methods for analyzing immunosignatures. BMC Bioinformatics. 2011; 12(349): 2-15.

Simon R., Lam A.P., Li M.C., Ngan M., Menenzes S., Zhao Y. Analysis of gene expression data using BRB-Array Tools. Cancer Informatics. 2007; 2: 11-7.

Подлесных С.В., Колосова Е.А., Щербаков Д.Н., Шайдуров А.А., Анисимов Д.С., Рязанов М.А. и др. Взаимодействие антител сыворотки крови пациентов при раке молочной железы с синтетическими пептидами. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины. 2016; 161(6): 775-9.

Ключевые слова