Дифференциация представителей Vibrio parahaemolyticus и Vibrio alginolyticus

ISSN: 0869-2084 (Print) ISSN: 2412-1320 (Online)

Посмотреть или загрузить статью

Читать

Аннотация Об авторах Список литературы Ключ. слова

Аннотация

Vibrio parahaemolyticus и Vibrio alginolyticus - филогенетически близкородственные виды. У них общие экологические ниши, одинаковые культуральные свойства и сходные биохимические признаки. Фенотипическая изменчивость и таксономическое сходство штаммов этих видов затрудняют дифференциацию по биохимическим признакам V. parahaemolyticus от V. alginolyticus. Для получения достоверных результатов диагностики использования дополнительных методов дифференциации и идентификации этих двух видов бактерий. Целью настоящей работы явилась сравнительная оценка эффективности биохимического тестирования, ПЦР-анализа и метода масс-спектрометрии для дифференциации видов V. alginolyticus и V. parahaemolyticus. В результате наших исследований проведен анализ методов дифференциации V. alginolyticus и V. parahaemolyticus на модели коллекции, включая атипичные штаммы этих видов. Для подтверждения видовой принадлежности штаммов V. alginolyticus и V. parahaemolyticus необходимо использовать в дополнение к биохимическим методам идентификации ПЦР-анализ с видоспецифичными праймерами генов металлопротеазы (коллагеназы) vppC и vapC. Метод MALDI-TOF масс-спектрометрии может служить дополнительным эффективным методом идентификации и межвидовой дифференциации видов V. alginolyticus и V. parahaemolyticus, выделенных из разных источников.

Об авторах

Рыковская Оксана Алексеевна

ФКУЗ Ростовский-на-Дону противочумный институт Роспотребнадзора 344002, Ростов-на-Дону, ул. М. Горького, 117/40 науч. сотр. plague@aaanet.ru

Список литературы

Montieri S., Suffredini Е., Ciccozzi M., Croci L. Phylogenetic and evolutionary analysis of Vibrio parahaemolyticus and Vibrio alginolyticus isolates based on gyrB gene sequence. New Microbiol. 2010; 33: 359-72.

Garrity G.M. Bergey’s manual of systematic bacteriology. The gammaproteobacteria. New York: Springer; 2005; 2В: 1108.

Hugh R., Sakazaki R. International committee on systematic bacteriology. Subcommittee on the taxonomy of vibrios. Int. J. Syst. Bacteriol. 1975; 25 (4): 389-91.

Хоулт Дж., Криг Н., Снит П., Стейли Дж., Уилльямс С., ред. Определитель бактерий Берджи. т. 1. Пер. с англ. М.: Мир; 1997.

Reilly G., Reilly C., Smith Е. Vibrio alginolyticus-associated wound infection acquired in British waters. Euro Surveill. 2011; 16 (42).

МУК 4.2.1793-03. Лабораторная диагностика заболеваний, вызываемых парагемолитическими и другими патогенными для человека вибрионами: Методические указания. М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора; 2003.

West P.A., Colwell R.R. Identification and classification overview. Vibrios in the environment. New York: John Wiley Sons, Inc.; 1984: 285-363.

Шалу О.А., Непомнящая Н.Б., Монахова Е.В. и др. ПЦР-генотипы штаммов Vibrio parahaemolyticus, выделенных от людей на территориях СНГ. В кн.: Холера и патогенные для человека вибрионы: материалы совещания специалистов Роспотребнадзора и проблемной комиссии. Ростов-на-Дону; 2010: 99-105.

Robert-Pillot A., Guenole A., Fournier J. Usefulness of R72H PCR assay for diferentiation between Vibrio parahaemolyticus and Vibrio alginolyticus species: validation by DNA-DNA hybridization. FEMS Microbiol. Lett. 2002; 215: 1-6.

Tarr C.L., Patel J.S., Puhr N.D. et al. Identification of Vibrio isolates by a multiplex PCR assay and rpoB sequence determination. J. Clin. » Microbiol. 2007; 45 (1): 134-40.

Ward L.N., Bej A.K. Detection of Vibrio parahaemolyticus in shellfish by use of multiplexed real-time PCR with TaqMan fluorescent probes. Appl. Environ. Microbiol. 2006; 72 (3): 2031-42.

Venkateswaran K., Dohmoto N., Harajama S. Cloning and nucleotide sequence of the gyrB gene of Vibrio parahaemolyticus and its application in detection of this pathogen in shrimp. Appl. Environ. Microbiol. 1998; 64 (2): 681-7.

Ключевые слова

#MALDI-TOF масс-спектрометрия #биохимические тесты #видоспецифичные гены #ПЦР-анализ