Генетические особенности доноров гемопоэтических стволовых клеток, проживающих в Новосибирске

Аннотация

Проведено HLA-типирование 200 потенциальных доноров гемопоэтических стволовых клеток, проживающих в Новосибирске, по локусам (HLA)-A, -B, -C, -DRB1. В ходе проведенных исследований в изучаемой популяции выявлены два новых аллеля, которые ранее не были зарегистрированы международным Комитетом по номенклатуре факторов HLA- системы ВОЗ. При изучении частот распределения HLA-аллелей и гаплотипов выявлено 16 аллельных вариантов локуса HLA-A, 24 - HLA-B, 13 - HLA-C, 13 - HLA-DRB1. Частотой встречаемости более 10% обладают следующие аллельные варианты: HLA-A*02 (29,25%), 01 (14%), 03 (13,5%), 24 (10,75%), HLA-B*35 (12,25%), 07 (12%), HLA-C*07 (29,75%), 06 (13%), 04 (12,5%), 12 (11,5%), 03 (10,75%), HLA-DRB1*13 (15,25%), 07 (13,75%), 01 (13%), 11 (12,75%), 15 (12,75%), 04 (10,5%). С использованием программного обеспечения Arlequin v.3.1 было выявлено 239 возможных гаплотипов HLA-A-B- C-DRB1. Наиболее часто встречающимися оказались гаплотипы A*01-B*08-C*07-DRB1*03, A*02-B*13-C*06-DRB1*07, A*03-B*35-C*04-DRB1*01 с частотами встречаемости 4,5; 2,75 и 2,75°% соответственно. Распределение аллелей и анализ гаплотипов позволили сравнить изученную популяцию с другими российскими популяциями.