Гиперметилированные гены микроРНК как потенциальные маркеры светлоклеточного рака почки

Аннотация

Светлоклеточный рак почки (скПКР) характеризуется высокой частотой летальных исходов, и в первый год после постановки диагноза летальность составляет 16%. Отсутствие эффективной диагностики в ранних стадиях (30% случаев скПКР обнаруживается в поздних стадиях при наличии метастазирования) указывает на необходимость поиска новых биомаркеров скПКР. Нарушения в метилировании регуляторных генов микроРНК являются одной из причин развития опухоли. Цель данной работы - выявление гиперметилированных генов микроРНК при скПКР и оценка их диагностических и прогностических характеристик. Определение статуса метилирования генов микроРНК в образцах ДНК из опухоли и неизмененной ткани 50 больных скПКР проводили с помощью бисульфитной конверсии ДНК и последующей метилспецифичной ПЦР. Показано частое гиперметилирование 7 генов микроРНК (miR-9-1/3, miR-124a-1/2/3, miR-34b/c, miR-129-2) в опухолях скПКР. Из 7 исследованных генов микроРНК составлены системы маркеров по 2-4 гена в каждой. Чувствительность систем из 4маркеров по даннымROC-анализа достигает 88%, а специфичность - 94% (AUC 0,83- 0,84). Кроме того, показано, что гиперметилирование 5 генов микроРНК (miR-9-1/3, miR-34b/c, miR-124a-3, miR-129-2) ассоциируется с параметрами прогрессии скПКР (стадия, размер опухоли, степень дифференцировки и метастазирование в лимфатические узлы или удаленные органы). Из генов, гиперметилирование которых связано с метастазированием (miR-129-2, miR-9-3, miR-124a-3), составлены и охарактеризованы 5 прогностических систем маркеров. Гиперметилирование гена miR-129-2 - новый эффективный маркер предсказания метастазирования (чувствительность 75% и специфичность 79%, AUC 0,77), который можно сочетать с маркерами, выявленными в других исследованиях.