Методы идентификации Corynebacterium non diphtheriae

ISSN: 0869-2084 (Print) ISSN: 2412-1320 (Online)

Посмотреть или загрузить статью

Читать

Аннотация Об авторах Список литературы Ключ. слова

Аннотация

Правильную идентификацию Corynebacterium non diphtheriao осложняет их большое видовое разнообразие, вариабельная биохимическая активность, а также, с одной стороны, широкий спектр заболеваний, при которых они выделяются, с другой - их присутствие в составе нормальной микрофлоры человека. Бактериологический метод является традиционной основой идентификации коринебактерий, но длителен (7-14 дней), дает неоднозначные результаты при культивировании липофильных и биохимически вариабельных видов. Для окончательной идентификации трудно определяемых видов C. non diphtheriaе рекомендуется проводить молекулярно-генетическое исследование с помощью золотого стандарта - секвенирования по 16S рРНК (ДНК), генам гроВ и PLD. При получении неоднозначных ответов секвенирования по 16S рРНК точная идентификация достигается путем секвенирования второстепенного гена гроВ, что позволяет обнаружить уникальные различия в последовательностях геномов у разньх видов коринебактерий (наличие генов вирулентности; отсутствие кластера генов, ответственных за продукцию ряда сахаролитических ферментов; наличие генов, кодирующих синтез определенных пигментов, и др.). Масс-спектрометрический метод (MALDI-ToF-MS), применяемый для скрининговой идентификации Corynebacterium, прост в исполнении, но требует совершенствования для более точной дифференциации близкородственных видов. Необходим полифазный подход к идентификации C. non diphtheriae, включающий хемотаксономическую, фенотипическую, генотипическую информацию, необходимую для достоверного описания новых клинически значимых видов коринебактерий.

Об авторах

Харсеева Галина Георгиевна

ГБОУ ВПО «Ростовский государственный медицинский университет» 344022, г. Ростов-на-Дону galinagh@bk.ru

Список литературы

1МР 4.2.00.20-11. Фенотипическая идентификация бактерий рода Corynebacterium (утв. Главным государственным санитарным врачом РФ 21.03.11, М.; 2011. 55 с.).

Coyle M.B., Lipsky В.А. Coryneform bacteria in infectious diseases: clinical and laboratory aspects. Clin. Microbiol. Rev. 1990; 3 (3): 227-46.

Knox K., Nolmes А. Nosocomial endocarditis caused by Corynebacterium amycolatum and other non diphtheriae Corynebacterium. J. Emerg. Inf. Dis. 2002; 8 (1): 97-9.

Reddy B.S., Chaudhury А., Kalawat U., Jayaprada R., Reddy G., Ramana B.V. Isolation, speciation, and antibiogram of clinically relevant non-diphtherial Corynebacteria (Diphtheroids). Indian J. Med. Microbiol. 2012; 30 (1): 52-7.

Лабинская А.С., Костюкова Н.Н., ред. Руководство по медицинской микробиологии. Книга 3. Том 1. Оппортунистические инфекции: возбудители и этиологическая диагностика. М.: Бином; 2013.

Анохин В.А., Халиуллина С.В., Назарова О.А., Хаертынов Х.С. Случай раннего неонатального сепсиса, обусловленного С. Amycolatum. Практическая медицина. 2012; (7): 178-80.

Bernard K.A. The genus corynebacterium and other medically relevant coryneform-like bacteria. J. Clin. Microbiol. 2012; 50 (10): 3152-8.

Харсеева Г.Г., ред. Дифтерия: микробиологические и иммунологические аспекты. М.: Практическая медицина; 2014.

Bernard K.A. Corynebacterium species and coryneforms: an update on taxonomy and diseases attributed to these taxa. Clin. Microbiol. Newsl. 2005; 27 (2): 9-18.

Харсеева Г.Г., Воронина Н.А., Миронов А.Ю., Алутина Э.Л. Сравнительный анализ методов идентификации Corynebacterium non diphtheriae. Клиническая лабораторная диагностика. 2015; (12): 43-6.

Rennie R.P., Brosnikoff C., Turnbull L., Reller L.B., Mirrett S., Janda W. et al. Multicenter evaluation of the Vitek 2 anaerobe and Corynebacterium identification card. J. Clin. Microbiol. 2008; 46 (8): 2646-51.

Fernandez-Natal M.I., Saez-Nieto J.A., Valdezate S., Rodriguez-Pollan R.H., Lapena S., Cachon F. et al. Isolation of Corynebacterium ureicelerivorans from normally sterile sites in humans. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2009; 28 (6): 677-81.

Vila J., Juiz P., Salas C., Almela M., Garcia de la Fuente C., Zboromyrska Y. et al. Identification of clinically relevant Corynebacterium spp., Arcanobacterium haemolyticum, and Rhodococcus equi by matrix-assisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry. J. Clin. Microbiol. 2012; 50 (5): 1745-7.

Venezia J., Cassiday P.K., Marani R.P., Shen Z., Buckley E.M., Peters Y. et al. Characterization of Corynebacterium species in macaques. J. Med. Microb. 2012; 61 (10): 1401-8.

Ключевые слова

#Corynebacterium non diphtheriaе #бактериологический метод #молекулярно-генетический метод